发通知函给对方公司催收是合适的，但具体效果还需根据实际情况来判断。以下是我从专业角度给出的详细分析：

1. 法律层面：

   • 催收合法性：在合同纠纷中，如果合同明确规定了催收条款，或者依据相关法律法规（如《中华人民共和国合同法》等），你有权向对方公司进行催收。发送通知函是一种正式、书面的催收方式，符合法律规定。
   • 证据留存：书面通知函可以作为你方已经履行催收义务的证据，为后续可能的法律诉讼或仲裁提供有力支持。

2. 实践层面：

   • 明确催收内容：在通知函中，应明确列出对方公司拖欠的款项、金额、支付期限以及逾期可能产生的法律后果，如利息、违约金等。
   • 正式性：通知函应采用正式的信函格式，加盖公司公章或由法定代表人签字，以增加其法律效力和正式性。
   • 催收效果：发送通知函可以起到提醒和警告的作用，有时对方公司在收到正式通知后会选择尽快支付欠款，以避免进一步的法律纠纷。

3. 策略考虑：

   • 时机选择：在决定发送通知函之前，可以考虑对方的财务状况、信用记录以及以往的合作情况，选择最佳的催收时机。
   • 后续行动：如果通知函发出后对方公司仍未支付欠款，你需要考虑采取进一步的法律行动，如提起诉讼或仲裁。

4. 注意事项：

   • 避免过激言辞：在通知函中，应保持客观、理性的态度，避免使用过激或威胁性的言辞，以免引起不必要的法律纠纷。
   • 法律咨询：在催收过程中，如果遇到复杂或难以处理的问题，建议及时咨询专业律师，以确保你的权益得到充分保护。

综上所述，发送通知函给对方公司催收是一种合法、有效的催收方式。但在具体操作过程中，还需根据实际情况灵活调整策略，并咨询专业律师的意见以确保万无一失。