在申请对建二层进行鉴定后，一般不可以直接开始施工，需根据鉴定结果和后续审批情况决定。具体分析如下：

1. 鉴定目的与施工许可的关系：

   • 鉴定通常是为了评估现有建筑结构的安全性、稳定性或合规性，特别是当涉及加建、改建等可能影响建筑整体结构安全的行为时。
   • 施工许可则是行政主管部门根据相关法律法规，对建设项目是否符合规划、安全、环保等要求进行审查后，颁发的允许施工的证明。
   • 鉴定本身并不等同于施工许可。即使进行了鉴定，也需要等待鉴定结果，并根据结果决定是否需要进一步调整设计方案或进行其他必要的准备工作。

2. 鉴定结果对施工的影响：

   • 如果鉴定结果为建筑结构安全，且加建二层符合当地规划和建筑法规的要求，那么可以按照正常流程申请施工许可，并在获得许可后开始施工。
   • 如果鉴定结果为建筑结构存在安全隐患或加建二层不符合相关法规要求，那么需要进行结构加固、调整设计方案或放弃加建计划等，之后才能重新申请鉴定或施工许可。

3. 法律程序与合规性：

   • 在进行任何建筑活动前，必须确保所有法律程序都已合规完成，包括但不限于规划审批、施工许可申请、安全鉴定等。
   • 未经许可擅自施工可能面临法律责任，包括但不限于罚款、停工整顿、拆除违法建筑等。

4. 建议与注意事项：

   • 在申请鉴定前，应详细了解当地规划和建筑法规，确保加建二层符合相关要求。
   • 鉴定过程中，应积极配合鉴定机构的工作，提供必要的资料和信息。
   • 鉴定结果出来后，应根据结果及时调整计划，并按照法律程序申请施工许可。
   • 在整个过程中，建议咨询专业律师或建筑师的意见，以确保所有行为都合法合规。