迟到扣年终奖是否违反劳动法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 如果公司规章制度或劳动合同中有明确规定：

   • 规章制度或劳动合同中明确规定了迟到等违纪行为将扣除年终奖，且该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等），并向劳动者进行了公示或告知，那么公司依据这些规定扣除年终奖，通常是合法的。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

2. 如果公司规章制度或劳动合同中没有明确规定：

   • 如果公司规章制度或劳动合同中并未明确规定迟到等违纪行为将扣除年终奖，那么公司单方面扣除年终奖可能缺乏合法依据，可能构成违法。
   • 法律后果：在这种情况下，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司补发被扣除的年终奖。如果公司拒绝补发，劳动者可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

3. 关于年终奖的性质和发放：

   • 年终奖是公司对员工一年工作表现的奖励，其性质属于劳动报酬的一部分。因此，公司在发放年终奖时，应当遵循公平、公正、合理的原则，不得随意克扣或剥夺。
   • 建议：为了避免类似纠纷的发生，建议公司在制定规章制度或劳动合同时，明确年终奖的发放条件、标准和方式，以及可能扣除年终奖的情形和程序。同时，公司也应当加强内部管理，确保规章制度的执行和公示，以维护劳动者的合法权益。

总结来说，迟到扣年终奖是否违反劳动法，取决于公司规章制度或劳动合同中是否有明确规定，以及该规定是否经过民主程序制定并公示或告知劳动者。如果公司规章制度或劳动合同中有明确规定，且符合法定程序，那么公司扣除年终奖可能是合法的；反之，则可能构成违法。如果你对此有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。