政府采购中的工程如何确定是适用《政府采购法》还是《招投标法》，主要取决于具体的采购方式和内容。以下是对此问题的详细分析：

1. 招标方式下的法律适用：

   • 当政府采购涉及工程，并且采用招标方式进行采购时，根据《政府采购法》第四条的规定，应适用《招投标法》。这意味着，在此类采购中，必须严格遵循《招投标法》关于招标的程序、内容等规定，包括招标公告的发布、招标文件的编制、投标、开标、评标、定标等各个环节。
   • 举例：某市政府计划建设一座新的市政大楼，通过公开招标的方式选择施工单位。在此情况下，该采购活动应适用《招投标法》，确保招标过程的公开、公平、公正。

2. 非招标方式下的法律适用：

   • 政府采购并不仅限于招标这一种方式。《政府采购法》第二十六条明确列出了包括公开招标、邀请招标、竞争性谈判、单一来源采购、询价等多种采购方式。对于采用非招标方式进行的政府采购，如竞争性谈判、单一来源采购等，则不适用《招投标法》，而应遵循《政府采购法》及其相关条例的规定。
   • 举例：某市政府因紧急情况需要采购一批特定的医疗设备，且由于设备特殊性，只有一家供应商能够提供。在此情况下，市政府可以选择单一来源采购方式，并遵循《政府采购法》的相关规定进行采购。

3. 两部法律的关联与区别：

   • 关联：虽然《招投标法》和《政府采购法》都涉及招标采购活动，但两者的调整范围和法律关系有所不同。《招投标法》主要是对招标的程序、内容进行规范，而《政府采购法》则是规范政府采购行为的一部实体法，涵盖了政府采购的各个方面，包括采购政策、原则、方式、程序等。
   • 区别：在政府采购活动中，除了在某些特定情形下（即政府采购工程进行招标投标）需要遵循《招投标法》外，还需遵守《政府采购法》关于政府采购政策、原则、方式等方面的全面规定。例如，政府采购应助力国家经济和社会发展政策目标，如环保、扶持不发达地区等，这些政策功能在《政府采购法》中有明确规定。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在实际操作中，应严格按照相关法律法规的规定执行，以确保政府采购活动的合法性和规范性。对于采用招标方式进行的政府采购工程，应同时遵守《招投标法》和《政府采购法》的相关规定，确保招标过程的公开、公平、公正，并满足政府采购的政策目标。
   • 对于供应商而言，了解并熟悉这两部法律及其相互关系，是参与政府采购工程招标投标的关键。供应商应仔细研究招标文件，了解采购方式、采购程序、评标标准等关键信息，并按照法律法规的要求准备投标文件，以确保投标的合法性和有效性。

总结与建议：政府采购中的工程在确定适用法律时，应首先判断采购方式。若采用招标方式，则适用《招投标法》；若采用非招标方式，则适用《政府采购法》。在实际操作中，应严格遵守相关法律法规的规定，确保政府采购活动的合法性和规范性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。