农村自建房合同期满后的处理方式，需结合合同具体约定、双方协商情况及法律规定综合判断。以下是具体分析：
优先依据合同约定处理
若合同中明确约定了期满后的处理方式（如续租条件、房屋返还标准、补偿条款等），双方应按合同履行。例如：
- 合同约定“期满后承租人需无条件返还房屋”，则承租人应腾退房屋并恢复原状；
- 合同约定“期满后优先续租”，则双方可协商续签合同。
关键点：合同条款是处理纠纷的首要依据，需仔细审查条款内容。
合同未约定或约定不明时的处理
若合同未约定期满后的处理方式，或约定模糊导致争议，可参考以下原则：
- 协商解决：双方可就续租、房屋返还、补偿等事项重新协商，并签订补充协议；
- 返还房屋：若无续租意愿，承租人应返还房屋，出租人应退还押金（如有约定）；
- 合理补偿：若承租人对房屋有装修或添附，可要求出租人给予合理补偿（需举证证明装修价值及合同未禁止装修）；
- 法律救济：若协商不成，可向法院起诉，由法院根据公平原则、交易习惯等判决。
关键点：无约定时，需结合实际情况和法律规定主张权利，避免单方面强行处理。
特殊情形下的处理
- 房屋被征收或拆迁：若合同期满前房屋被征收，补偿款分配需按合同约定或法律规定处理（如承租人可主张停产停业损失补偿）；
- 房屋存在质量问题：若房屋因质量问题影响使用，承租人可要求出租人维修或减少租金，甚至解除合同；
- 承租人死亡：若承租人死亡，其共同居住人可按合同约定或法律规定继续承租（需符合当地政策）。
关键点：特殊情形需结合具体事实和法律条款分析，不可一概而论。
建议：
- 合同期满前，双方应提前沟通续租或退房事宜，避免纠纷；
- 签订合同时，建议明确约定期满后的处理方式（如续租条件、补偿标准等）；
- 发生纠纷时，优先协商解决，协商不成可寻求法律途径维权。
如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为你详细分析。