结论：不服上诉法院的判决时，补交职工代表大会开除员工的证据或材料是否合法，需根据具体情况判断，但通常上诉阶段补交此类材料需符合法定程序和条件，否则可能不被采纳。以下从不同角度详细分析：
一、上诉阶段补交材料的合法性
法定程序要求：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，上诉阶段当事人可以提交新的证据或材料，但需符合“新证据”的条件，即该证据在原审程序中未能提供，且非因当事人自身原因导致未能提供。
- 若职工代表大会开除员工的决定是在原审程序结束后才作出或发现的，且该决定对案件结果有重大影响，那么该决定作为新证据在上诉阶段提交可能是合法的。
材料与案件关联性：
- 补交的材料必须与案件具有直接关联性，即能够证明开除员工的决定是否合法、合理，以及是否违反了相关法律法规或劳动合同。
- 若补交的材料与案件无关或无法证明开除决定的合法性，那么该材料可能不会被法院采纳。
二、职工代表大会开除员工的合法性审查
开除决定的程序合法性：
- 职工代表大会作为企业内部的管理机构，其开除员工的决定需遵循企业内部的规章制度和法定程序。
- 若开除决定未经过合法的程序（如未提前通知员工、未听取员工申辩等），则该决定可能被视为违法。
开除决定的实体合法性：
- 开除员工需有充分的理由，如员工严重违反企业规章制度、严重失职或营私舞弊等。
- 若开除决定缺乏充分的理由或证据支持，则该决定可能被视为违法。
三、上诉阶段补交材料的实践建议
及时提交并说明理由：
- 若需在上诉阶段补交职工代表大会开除员工的材料，应尽快提交，并详细说明该材料为何在原审程序中未能提供，以及该材料对案件结果的重要性。
确保材料真实性和合法性：
- 补交的材料必须真实、合法，且能够证明开除决定的合法性。若材料存在虚假或违法情况，不仅可能不被法院采纳，还可能面临法律责任。
寻求专业法律帮助：
- 上诉阶段涉及复杂的法律程序和实体问题，建议寻求专业律师的帮助，以确保补交的材料符合法定要求，并提高上诉成功的可能性。
四、可能的法律后果
材料被采纳：
- 若补交的材料符合法定要求，且能够证明开除决定的合法性，那么法院可能会采纳该材料，并据此对案件进行重新审理或判决。
材料不被采纳：
- 若补交的材料不符合法定要求，或无法证明开除决定的合法性，那么法院可能不会采纳该材料，并维持原判或作出其他判决。
进一步思考：在处理此类案件时，除了关注上诉阶段补交材料的合法性外，还应关注开除决定的程序合法性和实体合法性。若开除决定本身存在违法情况，那么即使补交的材料被法院采纳，也可能无法改变案件结果。因此，在处理劳动工伤纠纷时，应全面审查案件事实和法律依据，以确保当事人的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。