结论：关于“法定节补休要求三个月内休完，不休完扣除休息是否合法”的问题，这主要取决于补休的性质以及用人单位的具体规定和操作方式。一般情况下，法定休假日加班不能通过补休来替代加班费支付，若用人单位强制要求补休并在不休完时扣除休息，这种做法是不合法的。以下从不同角度进行分析：

一、法定休假日加班的法律规定

根据《劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬，且不得安排补休。这意味着，在法定休假日加班的情况下，劳动者有权获得额外的加班费，而用人单位不能通过安排补休来替代加班费的支付。

二、补休的适用范围

补休通常适用于休息日加班的情况。根据《劳动法》的相关规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这里明确指出了补休是休息日加班的一种补偿方式，但并未将其扩展到法定休假日加班的情形。

三、用人单位的规定与操作

1. 若用人单位规定法定休假日加班需补休：

   • 这种规定本身与《劳动法》的规定相冲突，因为法定休假日加班不能通过补休来替代加班费支付。
   • 如果用人单位强制要求劳动者在三个月内休完法定休假日的补休，并在不休完时扣除休息或工资，这种做法是不合法的。

2. 若用人单位与劳动者协商一致进行补休：

   • 尽管法定休假日加班原则上不能补休，但如果用人单位与劳动者协商一致，且劳动者自愿接受补休而非加班费，这种安排在法律上可能被视为有效。但这种情况较为特殊，且需要劳动者明确表示同意。

四、法律建议

1. 对于劳动者：

   • 如果用人单位要求你在法定休假日加班并安排补休，你有权拒绝并要求支付加班费。
   • 如果用人单位强制要求补休并在不休完时扣除休息或工资，你可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

2. 对于用人单位：

   • 应严格遵守《劳动法》的相关规定，不得将法定休假日加班与休息日加班混为一谈。
   • 在安排加班时，应明确告知劳动者加班的性质和补偿方式，并尊重劳动者的选择权。

五、可能的法律后果

如果用人单位违反《劳动法》的规定，未支付法定休假日加班费或强制要求补休并扣除休息或工资，可能面临以下法律后果：

• 由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
• 如果因此引发劳动争议，用人单位可能需要承担仲裁费用和诉讼费用，并可能面临败诉的风险。

综上所述，法定休假日加班不能通过补休来替代加班费支付。如果用人单位有此类要求，建议劳动者明确拒绝并要求支付加班费；同时，用人单位也应严格遵守法律规定，避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。