结论：公司不批准孕期因身体不适且医院已开具证明的长假，这种做法是不合理的，甚至可能违法。你可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《女职工劳动保护特别规定》第六条，女职工在孕期不能适应原劳动的，用人单位应当根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或者安排其他能够适应的劳动。对怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长劳动时间或者安排夜班劳动，并应当在劳动时间内安排一定的休息时间。
   • 同时，如果女职工因怀孕需要保胎休息或者因并发症等需要休息治疗的，用人单位应当根据医疗机构的证明安排其休息，并按照病假工资标准支付工资。

2. 公司行为分析：

   • 公司不批准你因孕期身体不适且医院已开具证明的长假，显然违反了上述法律规定。公司有义务根据医疗机构的证明，合理安排你的工作或休息，并支付相应的工资。

3. 维权途径：

   • 协商：首先，你可以尝试与公司进行协商，说明你的身体状况和医院的证明，要求公司合理安排你的工作或批准长假。
   • 投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，反映公司的不合理行为，并请求劳动监察部门介入调查和处理。
   • 劳动仲裁：如果投诉后问题仍未得到解决，你可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任，如支付病假工资、安排合理休息等。

4. 注意事项：

   • 在维权过程中，务必保留好医院的证明、与公司的沟通记录等相关证据，以便在需要时提供证明。
   • 同时，也要了解自己的权益和义务，避免在维权过程中因不了解法律而陷入被动。

后续建议：

• 如果你决定采取上述维权途径，建议先咨询我或当地劳动法律专业人士，了解具体的操作流程和注意事项。
• 在与公司协商或投诉时，保持冷静和理性，避免情绪化行为影响维权效果。
• 如果公司存在其他违法行为，如未支付工资、未缴纳社保等，也可以一并向相关部门反映或申请劳动仲裁。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。