工伤申请认定成功后，单位之前扣除的病假工资或假期应当按照工伤待遇标准重新核算并补足差额，单位不得以病假为由降低工伤职工的法定待遇。具体分析如下：

一、法律关系定性：工伤停工留薪期与病假的本质区别

1. 停工留薪期
   根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。该期限一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊的，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认可适当延长。

2. 病假
   病假适用于非因工负伤或患病的情形，依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期内的工资支付标准由企业根据地方规定执行（如最低工资的80%），且医疗期长度与工龄挂钩，与工伤停工留薪期无关。

关键区别：工伤停工留薪期是法定强制保障待遇，单位必须按原工资支付；病假是普通医疗期待遇，工资可按比例降低。二者不可混同。

二、单位扣减病假的违法性分析

若单位在工伤认定前以“病假”名义扣减工资或假期，可能涉及以下违法行为：

1. 未及时认定工伤的过错
   单位未在事故发生后30日内申请工伤认定（特殊情况可延长），导致职工被迫按病假处理，单位需承担停工留薪期工资补发责任。

2. 故意混淆待遇性质
   即使单位未及时申请工伤，但职工已自行申请且认定成功的，停工留薪期应从事故发生日起算，单位不得以“病假”为由削减待遇。

3. 工资支付标准违规
   根据《工伤保险条例》第六十四条，原工资福利待遇指工伤职工受伤前12个月的平均月缴费工资，单位若按病假工资支付，需补足差额。

三、实务操作建议

1. 职工行动步骤

   • 收集证据：保留工资条、考勤记录、医疗证明、工伤认定决定书等材料；
     
   • 书面要求补发：向单位发送书面函件，明确要求按停工留薪期标准补发工资及恢复假期；
     
   • 申请劳动仲裁：若单位拒绝，可在1年内向劳动仲裁委员会提起仲裁，主张补发工资、经济补偿等。

2. 单位合规要点

   • 及时申请工伤：事故发生后30日内提交申请，避免法律风险；
     
   • 停工留薪期管理：凭定点医疗机构出具的休假证明确定期限，期满后需进行劳动能力鉴定；
     
   • 待遇衔接：停工留薪期满后仍需治疗的，按病假或工伤康复规定处理，不得擅自停发待遇。

四、特殊情形处理

1. 单位未缴纳工伤保险
   根据《社会保险法》第四十一条，未参保的单位仍需承担全部工伤待遇支付责任，包括停工留薪期工资。

2. 停工留薪期与医疗期重叠
   若工伤职工在停工留薪期内治愈，期满后无需继续治疗；若需延长治疗，需经劳动能力鉴定委员会确认，此时可能转入病假或工伤康复期，待遇标准需重新核定。

总结：工伤认定成功后，单位必须按停工留薪期标准补发此前扣除的工资及假期待遇。若遇单位拒不履行，职工可通过劳动仲裁或诉讼途径维权。如有进一步证据或细节需要分析，可随时补充说明。