结论：商票到期拒付，对方同意清偿票据收回后，若未实际付款，债务关系不会消失。

详细分析：

1. 票据关系与基础关系：

   • 票据关系，即票据上的权利义务关系，是由票据行为（如出票、背书、承兑等）产生的。在本案例中，商票到期拒付，说明票据关系中的付款义务未得到履行。
   • 基础关系，即票据产生的原因或前提，如买卖合同、借贷合同等。商票的签发和流通往往基于一定的基础交易关系。

2. 票据收回与债务关系：

   • 对方同意清偿票据并收回，这通常意味着对方承认了票据上的债务，并愿意通过某种方式（如支付现金、提供其他担保等）来履行这一债务。
   • 然而，票据的收回并不等同于债务的清偿。如果对方在收回票据后并未实际付款，那么票据上的债务关系并未得到实质性的履行和消灭。

3. 法律后果：

   • 根据《中华人民共和国票据法》的相关规定，票据到期被拒绝付款的，持票人可以对背书人、出票人以及票据的其他债务人行使追索权。
   • 在本案例中，如果对方在收回票据后未付款，持票人仍然有权依据票据法和相关法律规定，向对方追索票据金额及可能产生的利息、费用等。

4. 实际操作建议：

   • 如果您作为持票人遇到了这种情况，建议首先与对方进行沟通，明确要求对方履行付款义务。
   • 如果沟通无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
   • 在此过程中，务必保留好相关证据，如票据、沟通记录、交易合同等，以便在需要时提供证明。

总结与提醒： 商票到期拒付后，即使对方同意清偿并收回票据，如果未实际付款，债务关系仍然存在。作为持票人，您有权依据法律规定向对方追索票据金额及相关费用。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。