公司以员工上班天数少为由拒绝承担公司应缴纳的社保，这一做法是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
从法律规定角度：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。这意味着，只要员工与用人单位建立了劳动关系，用人单位就有义务为其缴纳社保，而不以员工上班天数的多少为前提。
- 同时，该法第六十条规定，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。这进一步强调了用人单位缴纳社保的强制性和及时性，与员工上班天数无关。
从劳动关系本质角度：
- 劳动关系的建立是基于双方的意思表示一致，即员工同意为用人单位提供劳动，用人单位同意接受员工的劳动并支付报酬。一旦劳动关系建立，员工就享有获得劳动报酬、享受社会保险等权利。上班天数少可能是由多种原因造成的，如请假、休假、调休等，但这并不影响劳动关系的存在和员工应享有的社保权益。
- 如果公司以员工上班天数少为由拒绝缴纳社保，实际上是在剥夺员工应享有的合法权益，违反了劳动关系的公平、公正原则。
从实际操作和后果角度：
- 如果公司拒绝为员工缴纳社保，员工有权向当地的社会保险经办机构或劳动保障监察部门投诉。这些部门会依法对公司进行调查和处理，要求公司补缴社保费用，并可能对公司处以罚款等行政处罚。
- 此外，如果员工因公司未缴纳社保而遭受损失（如无法享受医疗保险待遇、失业保险待遇等），员工还有权要求公司承担赔偿责任。
建议：
- 如果你遇到了公司以上班天数少为由拒绝缴纳社保的情况，你可以先与公司进行沟通协商，要求公司依法为你缴纳社保。
- 如果沟通协商无果，你可以向当地的社会保险经办机构或劳动保障监察部门投诉，维护自己的合法权益。
- 在整个过程中，记得保留好相关的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在需要时提供证明。
如果你还有其他关于社保或劳动关系方面的问题，欢迎直接向我咨询。