结论：在退休返聘劳务合同纠纷一审立案时若未提出克扣工资、加班费的诉求，能否重新启动诉讼程序需分情况讨论。以下从不同角度为你详细分析：

一、若一审判决已生效

1. 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，一审判决生效后，当事人若认为判决有错误，一般应通过申请再审的方式寻求救济，而非重新启动诉讼程序。再审程序是对已经发生法律效力的判决、裁定、调解书，发现确有错误，依法再次进行审理的程序。
2. 法律建议：在这种情况下，若你认为一审判决未处理你关于克扣工资、加班费的诉求，且该诉求与案件有关联，你可以考虑以“遗漏诉讼请求”为由申请再审。但需要注意的是，申请再审需要满足一定的条件，如再审申请应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出等。
3. 可能后果：若再审申请被受理，法院将重新审理案件，包括你未提出的克扣工资、加班费的诉求。但若再审申请未被受理或再审后仍维持原判，则你将无法再通过诉讼程序解决该问题。

二、若一审判决未生效（即处于上诉期内）

1. 法律背景：在一审判决未生效的情况下，当事人有权在上诉期内提起上诉，请求上级法院对案件进行二审。二审法院将对一审判决进行全面审查，包括当事人未提出的诉求（若该诉求与案件有关联且一审法院未进行审理）。
2. 法律建议：若你希望解决克扣工资、加班费的问题，且一审判决尚未生效，你可以在上诉期内提起上诉，并在上诉请求中明确提出要求二审法院审理克扣工资、加班费的诉求。
3. 可能后果：若二审法院认为你的上诉请求有理，将可能改判或发回重审，从而解决你关于克扣工资、加班费的问题。但若二审法院维持原判，则你仍需考虑是否申请再审。

三、若选择另行起诉（一般情况不适用，但特殊情形可考虑）

1. 法律背景：在一般情况下，若一审判决已涉及劳务合同纠纷的主要事实，另行起诉可能因“一事不再理”原则而被驳回。但若克扣工资、加班费的诉求与一审已处理的诉求在事实上或法律上具有相对独立性，且未在一审中提出并非因你的过错导致，你可以考虑另行起诉。
2. 法律建议：在决定另行起诉前，建议你先咨询专业律师，评估另行起诉的可行性和风险。若律师认为另行起诉具有较大可能性被受理且有望胜诉，你可以准备相关证据材料并提起诉讼。
3. 可能后果：若另行起诉被受理且胜诉，你将获得关于克扣工资、加班费的判决。但若另行起诉被驳回或败诉，则你将无法再通过诉讼程序解决该问题（除非符合申请再审的条件）。

总结与建议：在退休返聘劳务合同纠纷一审立案时若未提出克扣工资、加班费的诉求，能否重新启动诉讼程序需根据一审判决是否生效以及具体情况来判断。建议你先评估一审判决的生效情况，并考虑上述不同情况下的法律建议。若你对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。