单位二级机构的违纪案件是否可以由机关单位审理，这主要取决于具体的案件性质、单位内部的规章制度以及相关法律法规的规定。以下从几个方面进行详细分析：

1. 案件性质与审理权限：

   • 如果违纪案件涉及的是单位二级机构内部的轻微违规行为，且单位内部规章制度明确规定了此类案件由机关单位（如上级主管部门或人事部门）进行审理，那么在这种情况下，机关单位是有权进行审理的。
   • 如果违纪案件性质严重，可能涉及违法犯罪行为，那么根据法律规定，此类案件应当由司法机关（如公安机关、检察院或法院）进行审理，机关单位则无权直接审理。

2. 单位内部规章制度：

   • 不同单位可能有不同的内部规章制度，这些规章制度会明确规定违纪案件的审理程序和审理机构。因此，在判断机关单位是否有权审理二级机构的违纪案件时，需要查阅并遵循单位内部的规章制度。
   • 如果单位内部规章制度未明确规定审理机构或审理程序，或者规定存在模糊之处，那么可能需要参考相关法律法规或行业惯例来确定审理机构。

3. 相关法律法规：

   • 在某些情况下，相关法律法规可能会对单位内部违纪案件的审理机构作出明确规定。例如，对于国有企业或事业单位的违纪案件，可能需要根据《企业职工奖惩条例》或《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关法律法规来确定审理机构。
   • 如果法律法规明确规定了审理机构，那么单位应当遵循法律法规的规定，不得擅自改变审理机构或审理程序。

4. 实际操作建议：

   • 在处理单位二级机构的违纪案件时，建议首先查阅单位内部的规章制度和相关法律法规，明确审理机构和审理程序。
   • 如果案件性质严重或涉及复杂法律问题，建议咨询专业律师或法律机构，以确保案件的合法性和公正性。
   • 在审理过程中，应当遵循公平、公正、公开的原则，确保当事人的合法权益得到保障。

总结来说，单位二级机构的违纪案件是否可以由机关单位审理，需要根据案件性质、单位内部规章制度以及相关法律法规的规定来综合判断。如果案件性质轻微且单位内部规章制度明确规定由机关单位审理，那么机关单位是有权进行审理的；如果案件性质严重或涉及违法犯罪行为，或者单位内部规章制度未明确规定审理机构或审理程序，那么可能需要由司法机关或其他相关机构进行审理。在处理此类案件时，建议遵循相关法律法规和单位内部规章制度的规定，并咨询专业律师或法律机构的意见。