结论：保险公司是否赔付取决于保险条款约定、事故原因认定及是否存在免责情形，需结合具体证据综合判断。以下是详细分析：

1. 保险条款的覆盖范围
   需首先核查您投保的车险类型（如车损险、第三者责任险等）及具体条款。若条款明确约定“因车辆自身故障或外部维修导致的事故损失属于保险责任”，且未将“非指定维修店维修”列为免责情形，则保险公司可能需赔付。但实践中，多数车损险条款会约定“因被保险人故意或重大过失导致的事故”“车辆自然磨损或本身质量问题”等为免责事由，需重点审查。

2. 事故原因的因果关系认定
   保险公司会重点调查起火原因是否与更换的喷油嘴直接相关。例如：

   • 若维修店安装的喷油嘴存在质量问题（如密封不严导致漏油），或维修操作不当（如未正确安装导致短路），可能被认定为“外部因素导致的事故”，符合赔付条件；
     
   • 若起火原因系车辆原有线路老化、燃油系统设计缺陷等与维修无关的因素，则可能被拒赔。
     关键证据：消防部门出具的《火灾事故认定书》、维修记录、喷油嘴质量检测报告等。

3. 维修店的法律责任与保险追偿
   若事故确因维修店过错导致，您在向保险公司索赔后，保险公司可能依据《保险法》第60条行使“代位求偿权”，即先赔付您后，再向维修店追偿。此时您需配合提供维修店信息、事故证据等材料。
   建议：若维修店存在明显过错（如无资质维修、使用劣质配件），可同时要求维修店承担侵权赔偿责任，与保险赔付并行主张。

4. 保险公司的免责抗辩
   保险公司可能以以下理由拒赔，需提前应对：

   • 未如实告知维修情况：若保险条款要求“车辆维修需到指定机构”，而您未履行告知义务，可能影响赔付；
     
   • 免责条款效力：若保险公司以“非指定维修店维修”为由拒赔，需审查该条款是否属于《保险法》第19条规定的“免除保险人依法应承担的义务”的无效条款；
     
   • 举证责任：保险公司需证明起火与维修无因果关系，若无法举证，则应赔付。

行动建议：

1. 立即报案并保护现场，配合消防部门调查；
   
2. 收集维修合同、付款凭证、喷油嘴购买记录等证据；
   
3. 联系保险公司要求定损，并书面要求其说明拒赔理由（若拒赔）；
   
4. 若协商无果，可向当地银保监会投诉或直接起诉保险公司及维修店。
   

如有进一步证据或条款细节，可随时向我补充说明，我会为您分析具体赔付概率及维权策略。