结论：加班期间摸鱼被扣工资是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
从公司规章制度角度：
- 如果公司有明确的规章制度，规定员工在加班期间不得从事与工作无关的活动（即“摸鱼”），并且该规章制度已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定）制定并公示，那么员工违反此规定，公司有权依据规章制度对员工进行相应的处罚，包括扣减工资。但需要注意的是，扣减工资的幅度应当合理，不能超过法定限度。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
从劳动合同角度：
- 如果劳动合同中明确约定了员工在加班期间应全身心投入工作，不得从事与工作无关的活动，并且约定了违反此规定的处罚措施（包括扣减工资），那么员工违反此约定，公司也有权依据劳动合同对员工进行处罚。但同样，处罚措施应当合理且合法，不能违反法律法规的强制性规定。
从法律法规角度：
- 即使公司有规章制度或劳动合同中的相关约定，但如果这些规定或约定违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准、工资支付规定等），那么这些规定或约定也是无效的。公司不能以员工“摸鱼”为由，违反法律法规的规定扣减员工工资。例如，公司不能因员工“摸鱼”而将其工资扣减至低于当地最低工资标准。
从实际操作角度：
- 在实际操作中，公司如果发现员工在加班期间“摸鱼”，应当首先进行提醒和警告，要求员工立即改正。如果员工拒不改正或多次违反规定，公司再考虑依据规章制度或劳动合同进行处罚。处罚前应当确保员工已经充分了解并知晓相关规定和处罚措施，避免因信息不对称或程序不当而引发劳动纠纷。
建议：
- 对于员工而言，应当遵守公司的规章制度和劳动合同的约定，全身心投入工作，避免在加班期间“摸鱼”。如果认为公司的处罚措施不合理或违法，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应当制定合法合理的规章制度和劳动合同条款，明确员工在加班期间的职责和义务以及违反规定的处罚措施。在处罚员工时，应当确保程序合法、处罚合理，并保留好相关证据以备不时之需。
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