结论：员工劳动仲裁被驳回后起诉，若交费晚交了两天，一般情况下仍可以起诉，但需尽快补缴诉讼费用并关注法院的具体要求和规定，以避免因逾期缴费而被视为撤诉。
分析说明：
起诉期限与诉讼费用缴纳：
- 劳动仲裁被驳回后，员工有权在法定期限内向法院提起诉讼。这一期限通常是固定的，如十五日等（具体期限需根据当地法律法规确定），从收到仲裁裁决书之日起计算。
- 提起诉讼时，需要按照法院的要求缴纳诉讼费用。诉讼费用的缴纳是启动诉讼程序的重要一环，但并非决定诉讼是否成立的唯一因素。
晚交诉讼费用的影响：
- 如果员工在起诉期限内提起了诉讼，但诉讼费用晚交了两天，这通常不会直接导致诉讼被驳回或视为未提起。然而，法院可能会根据具体情况，要求员工尽快补缴诉讼费用，并可能发出缴费通知或催缴通知。
- 如果员工在收到缴费通知或催缴通知后，仍未在规定期限内补缴诉讼费用，法院可能会视为其撤诉，即诉讼程序终止。
法院的具体要求和规定：
- 不同地区的法院可能对诉讼费用的缴纳有具体的规定和要求，包括缴费期限、缴费方式等。因此，员工在提起诉讼时，应仔细阅读法院的相关通知和要求，确保按照规定的期限和方式缴纳诉讼费用。
- 如果员工对缴费期限或方式有疑问，可以及时向法院咨询或寻求法律帮助，以避免因误解或疏忽而导致诉讼程序受阻。
特殊场景：
- 如果员工因特殊原因（如不可抗力、意外事件等）导致无法按时缴纳诉讼费用，可以向法院说明情况并申请延期缴纳。法院在审查后，可能会根据具体情况决定是否批准延期缴纳的申请。
行动建议：
- 尽快补缴诉讼费用：如果员工发现诉讼费用晚交了两天，应尽快与法院联系并补缴诉讼费用，以避免因逾期缴费而被视为撤诉。
- 关注法院通知：员工应密切关注法院的通知和要求，确保按照规定的期限和方式完成诉讼费用的缴纳和其他诉讼程序。
- 寻求法律帮助：如果员工对诉讼程序或诉讼费用的缴纳有疑问或困惑，可以及时向我咨询或寻求其他法律帮助，以确保自己的合法权益得到保障。