结论：双船舶所有人按份共有时，行政处罚决定书应明确被处罚主体、处罚依据及责任划分，实践中存在相关处罚案例。以下从法律适用、决定书制作要点及案例参考三个角度展开说明：
一、法律适用：按份共有人如何承担行政责任？
根据《行政处罚法》及《民法典》相关规定，双船舶所有人按份共有时，行政处罚的承担需遵循以下原则：
- 共同违法时：若两共有人共同实施违法行为（如未取得许可擅自航行），行政机关应将两人列为共同被处罚人，在决定书中明确各自责任比例（如按出资比例或过错程度划分）。
- 单独违法时：若违法行为由某一共有人单独实施（如擅自改装船舶），行政机关应仅处罚实际违法者，但需在决定书中注明船舶共有情况，避免后续执行争议。
- 连带责任例外：若法律明确规定需承担连带责任（如污染环境），行政机关可要求任一共有人承担全部责任，但被处罚人承担后有权向其他共有人追偿。
二、行政处罚决定书制作要点
决定书需包含以下核心内容，以体现按份共有特征：
- 被处罚主体信息：
- 列明两共有人的姓名/名称、身份证号/统一社会信用代码、联系方式；
- 注明船舶共有方式（如“A公司占60%份额，B个人占40%份额”）。
- 违法事实认定：
- 详细描述违法行为（如“2023年X月X日，该船在未取得航行许可的情况下，由A公司实际控制航行至XX水域”）；
- 明确共有人责任划分依据（如“根据《船舶登记条例》第X条及共有人协议，A公司负责船舶运营，应承担主要责任”）。
- 处罚依据与内容：
- 引用具体法律条款（如《海上交通安全法》第X条）；
- 注明处罚种类（罚款、吊销许可证等）及金额计算方式（如“按船舶价值10%罚款，A公司承担60%即X元，B公司承担40%即X元”）。
- 救济途径告知：
- 写明申请复议或提起诉讼的期限及机关（如“自收到本决定书之日起60日内向XX海事局申请复议，或6个月内向XX海事法院起诉”）。
三、典型处罚案例参考
案例1：共同违法按份担责
- 案情：甲、乙按份共有船舶，甲负责运营。2022年X月，该船因超载被海事部门查处。
- 处罚：决定书认定甲为直接责任人，但因乙作为共有人未履行监督义务，最终对甲罚款5万元（占70%），乙罚款2万元（占30%）。
- 依据：参照《行政处罚法》第32条（当事人有证据证明无主观过错的不予处罚），结合共有人协议中“乙有权查阅运营记录”的条款。
案例2：单独违法独立担责
- 案情：丙、丁共有船舶，丁私自将船舶抵押给第三方。
- 处罚：海事部门仅对丁作出“撤销抵押登记、罚款3万元”的处罚，决定书中注明“丙未参与违法行为，不承担责任”。
- 依据：根据《民法典》第307条（共有人对共有物的管理义务），丁的行为超出共有权范围，应独立担责。
提示：若您涉及具体案件，需提供船舶共有协议、违法行为证据等材料，我可进一步分析责任划分及处罚合法性。