一般情况下，员工不配合加班不会被开除，但特殊行业、岗位或违反合法有效的规章制度等情况下，用人单位有可能依据相关法律法规对员工进行处理，甚至解除劳动合同。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与劳动者权利
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要延长工作时间，需与工会和劳动者协商，且不得违反每日及每月的加班时间限制。这确立了加班的协商性和时限性原则。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十一条明确规定，用人单位不得强迫或变相强迫劳动者加班。这进一步强调了劳动者有权拒绝不合理的加班要求。
劳动者权利：
- 劳动者有权根据自己的意愿决定是否加班，且加班时间应受法律限制。这是法律赋予劳动者的基本权利。
- 在拒绝加班后，劳动者的正常工作不应受影响，用人单位不得降低其工资、福利待遇，或进行报复、歧视。
二、一般不会被开除的情况
- 法律保障：劳动者正常行使拒绝加班的权利，用人单位通常不能以此为由开除员工。因为加班并非劳动者的法定义务，而是基于双方协商一致的结果。
- 证据及合理性：若用人单位没有充分证据证明加班的必要性和合理性，仅因员工不配合加班就将其开除，这种做法是不合理且不合法的。用人单位可能因此面临劳动争议和法律责任。
三、可能会被开除的特殊情况
特殊行业或岗位：
- 如医疗、消防、电力供应等，这些行业的工作性质决定了在特定情况下需要员工随时加班以保障公共安全和正常的生产生活秩序。
- 若员工在这些行业或岗位无正当理由不配合加班，且可能对公共利益或生产安全造成严重影响，用人单位可依据相关规章制度和法律法规对员工进行处理，甚至解除劳动合同。但这种情况较为特殊，且需要严格的证据支持。
违反合法有效的规章制度：
- 如果用人单位的规章制度中明确规定了某些特定情况下员工必须加班，并且这些规章制度是经过民主程序制定、内容不违反法律法规，同时已向员工公示或告知。
- 员工在明知的情况下仍然无故不配合加班，严重违反了单位的规章制度，用人单位有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以员工严重违反用人单位的规章制度为由，解除与员工的劳动合同。但这种情况也需要严格的证据和程序支持。
四、劳动者维权途径
- 若劳动者因拒绝加班而被辞退，视为违法辞退，劳动者可通过申请调解、仲裁或提起诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位违法解除劳动合同的，劳动者有权要求继续履行劳动合同，或主张用人单位按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。经济补偿金的计算标准按员工在本单位工作的年限确定，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
五、综合建议
- 用人单位：应尊重劳动者的休息权，合理安排工作时间和任务，避免强制加班和违法辞退行为的发生。在特殊情况下需要加班时，应与员工充分沟通并说明紧急情况，尽量争取员工的理解和配合。
- 劳动者：应了解自己的权利，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如果因拒绝加班而被辞退，应及时咨询专业律师并申请劳动仲裁或提起诉讼。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。