补缴社保超过3年的法律文书并非一定由劳动仲裁出具，具体取决于争议的性质和解决途径。以下是详细分析：

1. 劳动仲裁的适用范围
   根据《劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动仲裁主要处理因确认劳动关系、劳动合同履行、解除或终止、工作时间、休息休假、社会保险等发生的争议。若劳动者与用人单位就社保补缴问题产生争议（如是否应补缴、补缴基数等），且双方无法协商一致，劳动者可向劳动仲裁委员会申请仲裁。若仲裁裁决支持劳动者诉求，用人单位需按裁决补缴社保，此时裁决书即具有法律效力。

2. 社保行政部门的处理权限
   根据《社会保险法》第六十三条，用人单位未按时足额缴纳社保费的，由社会保险征收机构（如税务局或社保局）责令限期缴纳或补足。若用人单位逾期未履行，社保征收机构可采取查询银行账户、划拨社保费、申请法院强制执行等措施。此过程中无需劳动仲裁介入，社保征收机构可直接出具行政文书（如《社会保险费限期补缴通知》）。

3. 超过3年补缴的特殊情形

   • 时效问题：劳动仲裁的时效为1年（从当事人知道或应当知道权利被侵害之日起计算），但社保补缴争议可能适用《劳动保障监察条例》第二十条的2年查处时效，或地方性法规中的特殊规定（如部分地区允许补缴3年内社保）。若争议超过时效，劳动仲裁可能不予受理，此时需通过社保行政部门追缴。
     
   • 行政追缴优势：即使超过劳动仲裁时效，社保行政部门仍可依据《社会保险法》要求用人单位补缴，且不受2年或3年时效限制（具体以地方规定为准）。例如，北京市规定，用人单位未缴社保的，劳动者可随时向社保部门投诉，社保部门可追溯至用工之日起补缴。

4. 法律文书的类型

   • 劳动仲裁文书：若通过仲裁解决，文书为《劳动仲裁裁决书》，明确补缴金额、期限等。
     
   • 行政文书：若通过社保行政部门解决，文书可能为《社会保险费限期补缴通知》《社会保险费征收决定书》等，同样具有强制执行力。
     
   • 法院文书：若用人单位拒不履行仲裁裁决或行政决定，劳动者或社保部门可申请法院强制执行，此时法院会出具《执行裁定书》。

建议：

• 若争议在时效内且双方对补缴事实无异议，可优先协商或通过社保行政部门解决，效率更高；
  
• 若争议复杂（如对补缴基数、年限有分歧），或用人单位拒不配合，建议通过劳动仲裁明确权利义务；
  
• 无论选择哪种途径，均需保留劳动合同、工资记录等证据，以支持诉求。
  

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