外包农民工的加班工资，原则上应由与其建立劳动关系的用人单位支付。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律关系角度
劳动关系确定：
- 外包农民工与用人单位之间若存在明确的劳动关系（如签订了劳动合同），则用人单位是支付加班工资的责任主体。
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位安排劳动者加班的，应当按照国家有关规定支付加班费。
劳务派遣或外包合同关系：
- 如果农民工是通过劳务派遣或外包方式进入用工单位工作的，那么与农民工建立劳动关系的是劳务派遣公司或外包公司。
- 在这种情况下，加班工资应由劳务派遣公司或外包公司支付，但用工单位若存在过错（如未按时支付劳务费用等），也可能需要承担连带责任。不过，这并不改变加班工资支付的第一责任主体是劳务派遣公司或外包公司的事实。
二、实际支付情况角度
直接支付：
- 在大多数情况下，加班工资会由用人单位直接支付给农民工。这是最直接、最常规的支付方式。
通过第三方支付：
- 在某些特殊情况下，如用人单位与劳务派遣公司或外包公司有特别约定，加班工资可能会通过第三方（如劳务派遣公司或外包公司）支付给农民工。
- 但这种支付方式并不改变加班工资的支付责任主体，即用人单位仍然是最终的责任方。如果第三方未按时支付加班工资，农民工仍有权向用人单位追讨。
三、特殊情况与注意事项
用工单位责任：
- 如果用工单位未按照劳务派遣协议或外包合同的约定支付劳务费用，导致劳务派遣公司或外包公司无法按时支付农民工加班工资的，用工单位可能需要承担连带责任。
证据保留：
- 农民工在主张加班工资时，应保留好相关证据，如加班记录、工资条、劳动合同等，以便在发生纠纷时能够证明自己的加班事实和应得的加班工资数额。
法律途径：
- 如果用人单位或劳务派遣公司、外包公司拒绝支付加班工资，农民工可以通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
建议：作为外包农民工，在签订劳动合同时应明确加班工资的支付方式和标准。在工作过程中，应保留好相关证据以备不时之需。如果遇到加班工资未支付的情况，可以先与用人单位或劳务派遣公司、外包公司协商解决；协商不成的，可以及时寻求法律帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。