您好，关于您提出的“两个单位工作过退休档案要合并吗”的问题，这主要涉及到养老保险关系的处理。以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，当您在两个或多个单位工作过，并且这些单位都为您缴纳了养老保险时，在您达到退休年龄并准备领取养老金时，确实需要处理这些养老保险关系。

一、跨省、直辖市工作的情况

如果您在不同省、直辖市存在养老保险关系，根据国办发【2009】66号文的规定，会确定一个养老保险待遇领取所在省（直辖市），并将您的养老保险关系归集至该待遇领取地。具体来说：

1. 如果您的基本养老保险关系在户籍所在地，那么由户籍所在地负责办理待遇领取手续，您享受基本养老保险待遇。

2. 如果您的基本养老保险关系不在户籍所在地，但在其基本养老保险关系所在地累计缴费年限满10年，那么在该地办理待遇领取手续，享受当地基本养老保险待遇。

3. 如果您的基本养老保险关系不在户籍所在地，且在其基本养老保险关系所在地累计缴费年限不满10年，那么会将其基本养老保险关系转回上一个缴费年限满10年的原参保地办理待遇领取手续。

4. 如果您的基本养老保险关系不在户籍所在地，且在每个参保地的累计缴费年限均不满10年，那么会将其基本养老保险关系及相应资金归集到户籍所在地，由户籍所在地按规定办理待遇领取手续。

二、同一省内不同地市工作的情况

如果您是在同一省内不同地市工作，并且都缴纳了养老保险，那么根据相关规定（如粤社保函【2021】66号文），从某个时间点（如2021年4月1日）起，您无须再申办企业职工养老保险关系省内转移接续。当您符合在该省领取基本养老待遇条件时，由省内最后参保地社保经办机构负责归集您的养老保险关系，并按规定发放基本养老金。

总结与建议

1. 合并档案：实际上，这里所说的“合并档案”更准确地说是“归集养老保险关系”。在您达到退休年龄时，社保部门会根据您的缴费情况和相关规定，将您的养老保险关系归集到一个地方，以便您领取养老金。

2. 操作流程：您无需自行操作合并或归集过程。当您达到退休年龄并准备领取养老金时，社保部门会主动与您联系，告知您需要提供的材料和办理流程。

3. 咨询与确认：为了确保您的权益得到保障，建议您在退休前主动咨询当地社保部门或相关机构，了解具体的政策规定和操作流程。

希望以上解答能够帮助您更好地理解和处理这个问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。