违法解除劳动合同后恢复工作，补发工资的税负问题，主要取决于补发工资的性质和数额。以下是对这一问题的详细分析：

1. 补发工资的性质：

   • 当用人单位违法解除劳动合同，劳动者要求恢复劳动关系并补发工资时，补发的工资实际上是对劳动者因违法解除而遭受的工资损失的补偿。
   • 这种补偿在性质上更接近于“赔偿金”或“损失补偿”，而非正常的工资收入。然而，在税务处理上，它通常仍被视为工资薪金所得的一部分，除非有特定的税务优惠政策适用。

2. 税务处理的一般原则：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，工资薪金所得属于个人所得税的征税范围。
   • 因此，补发的工资原则上需要缴纳个人所得税，除非符合免税条件或享受特定的税收优惠政策。

3. 特定情况下的税务处理：

   • 数额在当地上年度职工平均工资3倍以内的部分：如果补发的工资数额在当地上年度职工平均工资3倍以内，根据相关税务政策，这部分收入可能免征个人所得税。但这一规定通常适用于一次性补偿收入，如经济补偿金、生活补助费等，对于补发工资是否直接适用需结合具体税务解释和地方政策。不过，在缺乏直接针对补发工资免税的明确规定时，可参考类似的一次性补偿收入政策进行理解。
   • 超过三倍数额的部分：如果补发的工资数额超过当地上年度职工平均工资的3倍，那么超过部分需要缴纳个人所得税。这部分收入不会计入员工本年的综合收入所得，而是单独适用综合所得税率表进行计算。

4. 实际操作建议：

   • 咨询当地税务机关：由于税务政策可能因地区而异，且补发工资的税务处理可能涉及具体细节和解释，因此建议咨询当地税务机关以获取准确信息。
   • 保留相关证据：在处理补发工资的税务问题时，应保留好相关证据，如劳动合同、解除劳动合同的通知、工资单、补发工资的协议或法院判决等，以便在需要时提供证明。
   • 合理规划税务：如果补发工资数额较大，且可能涉及较高的税负，可以考虑在合法合规的前提下进行税务规划，如通过分摊收入、利用税收优惠政策等方式降低税负。

示例说明： 假设某地区上年度职工平均工资为10万元，劳动者因违法解除劳动合同而要求补发工资20万元。那么，在这20万元中，前30万元（即3倍职工平均工资）部分在符合特定条件下可能免征个人所得税（但需注意，此处的30万元是假设的3倍上限，实际应依据当地具体数据），而超过的0万元（在此示例中未超过，仅为说明计算方式）部分则需要单独计算并缴纳个人所得税。若实际补发工资超过30万元，则超出部分需按综合所得税率表计算纳税。

总结与建议： 违法解除劳动合同后恢复工作并补发工资时，税负问题需根据补发工资的性质和数额来确定。在处理此类问题时，建议咨询当地税务机关以获取准确信息，并保留好相关证据以便在需要时提供证明。同时，也可以考虑在合法合规的前提下进行税务规划以降低税负。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。