结论：长期病假员工在解除劳动关系时，要求按照病假前工资核算经济补偿金是否合理，需根据解除劳动关系的合法性及具体情形来判断。若用人单位合法解除，经济补偿金按离职前12个月平均工资计算，可能低于病假前工资；若用人单位违法解除，则需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金，此时赔偿金的计算基数同样为离职前12个月平均工资。以下为详细分析：
一、合法解除劳动关系的情形
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同，并支付经济补偿金。
- 经济补偿金的计算依据为《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条及《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，即经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
经济补偿金计算：
- 计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月平均工资
- 月平均工资确定：若员工病假导致实际工作不足12个月，月平均工资可按实际工作月数计算，但不得低于当地最低工资标准。例如，员工病假6个月，实际工作6个月，则月平均工资为这6个月的平均应得工资。
- 特殊情形：对于高收入者（月工资高于当地职工月平均工资三倍），经济补偿金按三倍封顶，且最高不超过12个月。
示例：
- 员工A工作5年，病假6个月后医疗期满，无法从事原工作且单位安排的新岗位仍无法胜任，单位合法解除合同。若A离职前12个月平均工资（考虑病假期间工资可能较低）为6000元，则经济补偿金 = 5 × 6000 = 30,000元。此时，经济补偿金可能低于病假前工资，但符合法律规定。
二、违法解除劳动关系的情形
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
赔偿金计算：
- 计算公式：赔偿金 = 经济补偿金 × 2
- 月平均工资确定：同样依据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，以离职前12个月的平均工资为基数。
示例：
- 员工B在病假期间被单位无故辞退，属于违法解除。若B工作3年，离职前12个月平均工资为5000元，则赔偿金 = 3 × 5000 × 2 = 30,000元。此时，赔偿金的计算基数也是离职前12个月的平均工资，可能低于病假前工资，但赔偿金额是经济补偿金的两倍。
三、注意事项与建议
- 证据留存：员工应保存病假证明、工资记录等材料，以证明病假期间及离职前的工资情况；用人单位需提供合法解除的依据，如医疗期届满证明、调岗通知等。
- 协商优先：建议双方通过协商解决争议，避免诉讼成本和时间成本。
- 法律救济：若对补偿金额有异议，员工可向劳动仲裁机构申请仲裁或提起诉讼，以维护自身合法权益。
总结：长期病假员工在解除劳动关系时，经济补偿金或赔偿金的计算基数为离职前12个月的平均工资，而非病假前工资。因此，要求按照病假前工资核算经济补偿金或赔偿金在一般情况下是不合理的。但具体金额需根据解除劳动关系的合法性及工作年限、月平均工资等因素综合确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。