结论：在民事诉讼案中，若法院对主要证据在庭审中已进行质证，但在判决文书中未采纳也未说明理由，这通常是不符合法律规定的程序要求，当事人可以依法提出异议或上诉。
详细分析：
法律程序要求：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院在审理案件时，应当对当事人提交的证据进行质证，并在判决文书中对证据的采纳与否及其理由进行说明。这是保障当事人诉讼权利、确保审判公正的重要程序要求。
未说明理由的后果：
- 如果法院在判决文书中未对主要证据的采纳与否及其理由进行说明，这可能构成程序违法。程序违法可能影响判决的公正性和合法性，因此当事人有权对此提出异议。
当事人的权利：
- 提出异议：当事人可以在收到判决书后，在法定期限内向法院提出异议，要求法院对未说明理由的证据采纳问题进行补充说明或纠正。
- 上诉：如果当事人认为判决存在程序违法或其他错误，影响其实体权利，还可以在法定期限内向上一级法院提起上诉，请求撤销原判决并改判。
实际操作建议：
- 仔细审查判决书：当事人应仔细审查判决书，特别是关于证据采纳和理由说明的部分，确保自己的权益没有受到侵害。
- 及时咨询律师：如果发现判决书存在程序违法或其他问题，当事人应及时咨询专业律师，了解自己的权利和可行的救济途径。
- 准备上诉材料：如果决定上诉，当事人应在律师的指导下准备上诉材料，包括上诉状、证据材料等，确保上诉的合法性和有效性。
法律背景：
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第六十八条：“证据应当在法庭上出示，并由当事人互相质证。对涉及国家秘密、商业秘密和个人隐私的证据应当保密，需要在法庭出示的，不得在公开开庭时出示。”
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第一百五十七条：“裁定适用于下列范围：……（七）补正判决书中的笔误或者遗漏；……对前款第一项至第三项裁定，可以上诉。裁定书应当写明裁定结果和作出该裁定的理由。裁定书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章。口头裁定的，记入笔录。”（虽然此条直接规定的是裁定，但判决文书也应遵循类似的说明理由原则）
进一步思考：
- 当事人应充分了解自己的诉讼权利，包括质证权、异议权、上诉权等，并在诉讼过程中积极行使这些权利。
- 法院在审理案件时，应严格遵守法律程序，确保审判的公正性和合法性，避免程序违法对当事人权益造成侵害。
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