针对您提出的“行政许可程序违法，经办人怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
当行政许可程序出现违法情况时，经办人作为直接参与行政许可流程的人员，其处理方式需依据违法行为的性质、情节以及相关法律法规的规定来综合确定。以下是一些主要的处理方向及建议：
一、内部调查与责任认定
启动内部调查：
- 行政机关在发现行政许可程序违法后，应立即启动内部调查程序，查明违法事实、原因及责任人员。
责任认定：
- 根据调查结果，明确经办人在违法过程中的具体行为、责任大小及是否存在故意或过失。
二、根据违法情节采取相应措施
责令改正与警告：
- 若经办人的违法行为情节较轻，且未造成严重后果，行政机关可责令其立即停止违法行为，并在规定期限内改正。同时，可给予警告，以提醒其重视并避免再次发生类似行为。
行政处分：
- 若经办人的违法行为情节较重，或存在故意违规、玩忽职守等情形，其所在单位、上级机关或监察机关应依法给予行政处分，如警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等。
承担法律责任：
- 若经办人的违法行为触犯了刑法或其他相关法律法规，如受贿、滥用职权等，应依法追究其刑事责任或民事责任。此时，行政机关应将案件移送司法机关处理。
三、完善行政许可程序与监督机制
加强培训与教育：
- 行政机关应加强对经办人的培训与教育，提高其法律意识和业务水平，确保行政许可程序的合法性和规范性。
完善监督机制：
- 建立健全行政许可的监督机制，包括内部监督和外部监督。通过定期检查、随机抽查、社会举报等方式，及时发现并纠正行政许可程序中的违法行为。
强化责任追究：
- 对于行政许可程序中的违法行为，应坚持“谁违法、谁负责”的原则，强化责任追究。确保经办人对其违法行为承担相应的法律责任，以维护行政许可制度的严肃性和公正性。
四、法律依据与参考
- 在处理行政许可程序违法问题时，经办人及行政机关应严格依据《中华人民共和国行政许可法》及其他相关法律法规的规定进行。这些法律法规为行政机关提供了明确的法律指导和依据，确保处理过程的合法性和规范性。
综上所述，当行政许可程序出现违法情况时，经办人应根据违法情节的轻重承担相应的法律责任。同时，行政机关也应加强培训与教育、完善监督机制并强化责任追究，以确保行政许可制度的正确实施和维护公共利益。