结论前置：实习协议中约定“不能擅自结束实习期限”的条款本身并不违法，但该条款不能完全剥夺你依法解除协议的权利。你可以通过协商、法定解除或依据协议约定解除等方式结束实习，但需注意可能承担的违约责任。以下从不同角度为你详细分析：

1. 条款的合法性分析

• 不违反法律强制性规定：实习协议本质上是民事合同，只要双方意思表示真实、内容不违反法律或行政法规的强制性规定（如《劳动合同法》中关于劳动合同的特殊规定，但实习关系一般不适用该法），该条款即合法有效。因此，协议中约定“不能擅自结束实习期限”本身不违法。
• 限制解除权的合理性：虽然条款合法，但其合理性需结合具体情境判断。如果条款完全排除了你依法解除协议的权利（如因个人发展、健康原因等），可能因显失公平而被认定为无效或可撤销。但实践中，法院或仲裁机构会倾向于保护实习生的基本权益，允许在合理情况下解除协议。

2. 你依法解除协议的权利

• 协商解除：你可以与实习单位协商一致解除协议，这是最稳妥的方式。即使协议有禁止擅自解除的条款，双方协商一致后仍可解除，且无需承担违约责任。
• 法定解除权：根据《民法典》第五百六十三条，若实习单位存在严重违约行为（如未提供约定条件、拖欠报酬、侮辱人格等），你有权单方解除协议，并可要求赔偿损失。
• 通知解除权：若协议未约定解除条件，且实习单位无过错，你仍可提前通知解除（如提前3日或按协议约定），但可能需承担违约责任（如赔偿实习单位因你提前离职产生的损失）。

3. 违约责任的承担

• 协议有约定时：若协议明确约定了擅自解除的违约责任（如支付违约金、赔偿损失等），你需按约定承担。但违约金过高时，可依据《民法典》第五百八十五条请求法院或仲裁机构调整。
• 协议无约定时：若协议未约定违约责任，实习单位需证明实际损失（如重新招聘的成本、项目延误的损失等），你仅需在合理范围内赔偿。

4. 实务建议

• 优先协商：尝试与实习单位沟通，说明解除原因（如升学、就业等），争取理解并达成一致。
• 留存证据：若因实习单位过错解除，需保存证据（如拖欠工资的记录、侮辱人格的聊天记录等），以备维权。
• 谨慎签署协议：未来签署实习协议时，可要求修改不合理的条款（如增加“双方协商一致可解除”或“实习生提前X日通知可解除”等条款），或明确违约责任的计算方式。

总结：实习协议中的“不能擅自结束实习期限”条款不能完全剥夺你依法解除协议的权利。若需解除，建议优先协商；若无法协商，可依据法定或约定条件解除，并注意违约责任的承担。如有具体纠纷，可进一步向我咨询细节。