关于“羁押期间不应该扣工资吗”这一问题，结论是：员工被羁押期间工资是否发放，需根据员工的身份、用人单位的规定以及后续司法处理结果来综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行详细分析：
一、一般情况下的处理原则
暂停履行劳动合同：
- 当员工因涉嫌违法犯罪被有关机关羁押，导致人身自由受限时，用人单位可依据相关规定，选择暂时停止劳动合同的履行。这是因为员工在此期间无法正常为用人单位提供劳动服务。
工资发放的合理性：
- 工资是劳动者提供劳动的报酬。在员工被羁押无法提供劳动的情况下，用人单位基于权利义务对等原则，可不承担支付工资的义务。这一原则体现了劳动关系的公平性和合理性。
错误羁押的赔偿：
- 若员工最终被证明是被错误限制人身自由，其因暂时停止履行劳动合同期间的损失，可依据《国家赔偿法》向相关部门申请赔偿，而非向用人单位主张工资权益。这为员工在遭遇错误羁押时提供了法律救济途径。
二、特殊身份人员的处理规定
- 国家工作人员：
- 根据相关规定，国家工作人员在被采取强制措施或被拘留期间，若最终被认定为无罪或免予刑事处罚，其被羁押期间的工资应予补发。这体现了对国家工作人员合法权益的保护。
- 若国家工作人员被判处拘役、有期徒刑宣告缓刑等刑罚，则被羁押期间停发工资，改按本人原基本工资的75%计发生活费，且该期间不计入工作年限。这一规定既考虑了员工的实际生活需求，也体现了对违法行为的惩戒。
三、企业员工的处理建议
尚未被定罪判刑阶段：
- 若员工被采取强制措施但最终未被认定有罪，企业一般应按劳动合同约定支付工资。因为限制人身自由并非员工过错，企业应保障员工的合法权益。
被判刑后：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除劳动合同。具体而言：
- 若判处拘役、有期徒刑宣告缓刑，企业可自主决定是否留用。留用时，工资标准可自主确定，但通常低于正常工作水平；若解除劳动合同，则停发工资。
- 若判处实刑，从判决生效执行刑罚之日起，劳动关系自然解除，企业无需支付工资。
无罪释放或相关机关撤案后的处理：
- 若职工在羁押期间被证明无罪，或者公安、检察机关撤案，以及检察机关决定不予起诉，那么根据具体情况，职工可能获得被羁押期间的工资补发。具体补发情况还需考虑职工是否被劳动教养或治安拘留，以及原单位是否给予行政纪律处分等因素。
四、地区差异与企业规定
- 实践中，不同地区对羁押期间工资支付的规定可能存在差异。因此，在处理此类问题时，需结合当地的具体规定进行操作。
- 企业规章制度中关于此类情况的规定，只要不违反法律法规的强制性规定，也是处理此类问题的重要参考。企业应制定明确的规章制度，以规范员工在羁押期间的工资处理问题。
总结与建议
羁押期间工资是否发放是一个复杂的问题，需要根据员工的身份、羁押原因及后续司法处理结果来综合判断。用人单位在处理此类问题时，应严格遵守相关法律法规，同时考虑公平、合理的原则，确保既维护自身合法权益，又保障员工的正当权益不受侵害。如果您或您身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供详细的法律建议和指导。