结论：有病假条但公司不批假是否算旷工，不能一概而论，需结合具体情况判断。若员工已按规定履行请假手续且病假证明真实有效，公司无正当理由不批并视为旷工，则公司做法可能违法；反之，若员工未履行请假手续或病假证明存在问题，公司按旷工处理可能是合理的。
详细分析：
员工已按规定履行请假手续且病假证明真实有效
- 情况说明：员工按照公司规章制度，提前或及时提交了正规医疗机构出具的诊断证明、病假单等材料，且病情确实需要休假治疗。
- 法律分析：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，员工享有合法的医疗期，公司应给予一定的医疗假期，并不得随意解除劳动合同。在此情况下，公司无正当理由不批准病假并按旷工处理，是违法的。
- 举例：小李患急性疾病，提供了医生开具的病假单，但公司仍以业务繁忙为由不批准，并按旷工处理。此时，小李可以依法维护自己的权益。
员工未履行请假手续或病假证明存在问题
- 情况说明：员工未按照公司规定的请假流程操作，如未及时提交病假证明、仅口头请假未获公司明确同意，或提交的病假证明虚假、不正规、缺乏医学依据。
- 法律分析：公司有权对员工的病假申请进行审批，若员工未履行请假手续或提供的病假证明存在问题，公司有权不批准并按旷工处理。但即便如此，公司也应建立合理的调查和沟通机制，确保处理结果的公正性。
- 举例：小张突发疾病后仅电话告知公司便未再上班，也未及时补交相关证明材料。在公司多次联系要求提供时未予理会。此时，公司按旷工处理虽有一定合理性，但仍需确保程序公正。
紧急情况解除后未及时补办手续
- 情况说明：员工因突发疾病紧急就医无法及时请假，但紧急情况解除后，未及时向公司说明情况并补办请假手续。
- 法律分析：公司通常会理解员工因突发疾病紧急就医的情况，但紧急情况解除后，员工需及时向公司说明情况并补办请假手续。否则，公司按旷工处理可能是合理的。
法律建议与权益保护：
- 沟通协商：员工首先应与公司进行沟通协商，说明自己的病情和请假的合理性，争取公司的理解和认可。
- 保留证据：员工在请假过程中应妥善保留相关证据，如病假单、诊断证明、请假申请记录等，以备不时之需。
- 劳动监察投诉：若协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉，由其对公司的行为进行调查和处理。
- 劳动仲裁与诉讼：员工还可以选择申请劳动仲裁或通过法律途径提起诉讼来维护自己的合法权益。
公司规章制度的重要性：
- 公司的规章制度应明确规定病假的申请流程、审批权限及旷工的认定标准等。若规章制度中明确规定了员工请病假不批即视为旷工，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么在一定程度上可以作为处理此类问题的依据。但即便如此，公司也应确保规章制度的合理性和公正性，避免侵害员工的合法权益。
综上所述，有病假条但公司不批假是否算旷工，需结合具体情况判断。员工在请假时应遵守公司规定流程，并保留好相关证据；而公司在处理员工病假申请时也应遵循法律法规和公司规章制度，确保处理结果的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。