在甲方拖欠工程款的情况下，纳税义务时间的确定需结合具体税种及合同履行情况综合判断，主要依据《中华人民共和国增值税暂行条例》《中华人民共和国企业所得税法》及相关实施细则，具体分析如下：

1. 增值税纳税义务时间

根据《增值税暂行条例》第十九条及《营业税改征增值税试点实施办法》（财税〔2016〕36号）第四十五条，增值税纳税义务发生时间为：

• 收讫销售款项或取得索取销售款项凭据的当天：若合同明确约定付款时间（如分期付款、竣工结算后支付等），即使甲方未实际支付，纳税人仍需在合同约定时间申报增值税。例如，合同约定“竣工验收后30日内支付工程款”，则纳税义务时间为验收后第30日。
• 先开具发票的，为开具发票的当天：若纳税人提前开具增值税发票，无论甲方是否付款，均需以开票日为纳税义务时间。
• 未签订书面合同或合同未约定付款时间的，为工程完工并交付使用的当天：若缺乏明确约定，则以工程实际交付日为纳税义务时间。

特殊情形：若甲方长期拖欠且纳税人已提起诉讼或仲裁，需结合司法程序进展判断。例如，法院判决甲方支付工程款后，纳税人仍需以合同约定或实际交付日为纳税义务时间，但可依据《税收征收管理法》申请延期纳税或分期缴纳。

2. 企业所得税纳税义务时间

根据《企业所得税法实施条例》第九条及第二十三条，企业所得税收入确认遵循“权责发生制”原则，具体为：

• 工程款实际收到或应计收入时确认：若合同约定分期付款，企业应按完工进度或合同约定收款时间确认收入，即使甲方未支付，仍需在当期申报企业所得税。例如，合同约定“按工程进度支付80%款项”，则企业应在达到进度时确认80%收入。
• 未实际收款的，可计提坏账准备：若甲方拖欠导致款项无法收回，企业可依据《企业所得税法》第十条及《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》规定，提供合同、催收记录、司法判决等证据，在税前扣除坏账损失，但需经税务机关审核。

3. 实务建议

• 合同条款设计：在签订工程合同时，明确约定付款时间、违约金条款及税务处理方式，避免因条款模糊导致纳税义务争议。
• 证据留存：保留工程进度证明、交付验收单、催收记录、诉讼文书等证据，以证明纳税义务发生时间及坏账损失合理性。
• 税务申报调整：若甲方拖欠导致实际收款晚于纳税义务时间，企业可在申报时备注说明情况，并依据税务机关要求提供补充材料。
• 法律救济途径：若甲方恶意拖欠，企业可依据《民法典》第八百零七条行使工程价款优先受偿权，或通过诉讼、仲裁追讨欠款，同时申请税务机关延期纳税。

总结：纳税义务时间的确定需以合同约定、实际交付或开票时间为基准，结合税法规定综合判断。企业应通过完善合同条款、留存证据及合理运用税务政策，降低因甲方拖欠导致的税务风险。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。