结论：上班未打卡扣一天工资是否可以申请补回来，需分情况讨论，主要取决于公司规章制度的合法性、合理性以及是否与劳动合同或集体合同相冲突。

分析如下：

1. 公司规章制度合法且合理：

   • 如果公司的规章制度明确规定了未打卡将扣除相应工资，并且这一规定在制定过程中遵循了民主程序（如经过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定），同时已向劳动者公示或告知，那么该规定在法律上通常是有效的。
   • 在此情况下，如果员工确实未打卡，且无法提供合理理由或证据证明其已出勤，公司依据规章制度扣除一天工资，员工申请补回工资的难度较大。但员工仍可以尝试与公司协商，看是否能达成妥协或找到其他解决方案。

2. 公司规章制度不合法或不合理：

   • 如果公司的规章制度未经过民主程序制定，或者未向劳动者公示或告知，那么该规定在法律上可能被视为无效。
   • 另外，即使规章制度合法，但如果其内容显失公平（如扣除的工资数额远超过员工实际未出勤的损失），也可能被认定为不合理。
   • 在此情况下，员工有权向公司提出异议，并可以申请劳动仲裁或提起诉讼，要求公司补回被扣除的工资。

3. 劳动合同或集体合同有特别约定：

   • 如果劳动合同或集体合同中明确规定了关于打卡和工资扣除的特别条款，且这些条款与公司的规章制度不一致，那么应优先适用劳动合同或集体合同的约定。
   • 在此情况下，员工可以根据劳动合同或集体合同的约定来主张自己的权益，包括申请补回被扣除的工资。

建议：

• 员工应首先仔细审查公司的规章制度、劳动合同和集体合同，了解自己的权利和义务。
• 如果认为公司的扣除行为不合法或不合理，可以尝试与公司协商解决。
• 如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。