在申请强制执行期间，如果对方已经主动履行了还款义务，您可以按照以下详细且有条理的步骤来处理：
一、确认还款情况
核实金额：首先，您需要仔细核对对方偿还的金额是否与生效法律文书（如判决书、调解书等）上所确定的金额完全一致。这是确保对方已完全履行还款义务的关键步骤。
保留证据：确保您妥善保留了所有与还款相关的证据，如银行转账记录、收据、对方的书面确认等。这些证据在后续向法院申请结案或撤销执行申请时，将起到至关重要的作用，能够证明对方已经履行了还款义务。
二、通知执行法院
及时告知：一旦确认对方已经还款，您应立即将这一情况告知执行法院。这可以通过提交书面申请或直接联系承办法官来完成，确保法院能够及时了解案件的最新进展。
提供证据：在通知法院的同时，向法院提供还款的相关证据，以便法院能够核实还款事实并作出相应处理。这些证据将有助于法院快速、准确地作出结案或撤销执行的裁定。
三、申请结案或撤销执行申请
申请结案：如果法院已经对案件进行了立案执行，且对方已经全额履行了还款义务，您可以向法院提交书面申请，请求法院作出结案裁定。法院在核实相关情况后，会正式终结执行程序，并通知双方当事人。
撤销执行申请：在某些情况下，如果您认为继续执行已无必要（例如，对方已经提前还清了全部债务，或者双方已经达成了和解协议并已履行完毕），您也可以向法院提出撤销执行申请。法院在审查后，可能会同意您的申请并终止执行程序。
四、后续事项处理
解除保全措施：如果在执行过程中，法院采取了财产保全措施（如查封、扣押、冻结等），在对方履行还款义务后，您应及时向法院申请解除这些保全措施。这是为了避免给对方造成不必要的损失，并确保双方权益得到全面保障。
关注费用退还：根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，如果执行申请费是由您预交的，且在执行过程中双方达成和解协议并已履行完毕的，法院可能会根据实际情况决定是否退还部分或全部执行申请费。因此，您可以关注这一费用的退还情况，并及时向法院咨询相关流程。
在整个处理过程中，建议您保持与法院和对方的良好沟通，确保所有步骤都按照法律程序进行。同时，妥善保存所有相关文件、证据等材料，以备后续可能出现的争议或查询。这样，您就能确保在对方还款后，顺利终结执行程序，并保障自己的合法权益。