在申请强制执行期间，如果对方主动履行了还款义务，您可以按照以下详细步骤来处理：
一、确认还款情况
核实金额：首先，您需要仔细核对对方偿还的金额是否与生效法律文书（如判决书、调解书等）所确定的金额完全一致。这是确保您的权益得到完全保障的重要一步。
保留证据：确保您保留了所有与还款相关的证据，如银行转账记录、收据、对方的书面确认等。这些证据是证明对方已经履行了还款义务的关键，也是后续向法院说明情况时的重要依据。
二、及时通知执行法院
提交书面申请或联系承办法官：一旦确认对方已经还款，您应立即将这一情况告知执行法院。这可以通过提交书面申请或直接联系承办法官来完成，确保法院能够及时了解案件的最新进展。
提供还款证据：在通知法院的同时，向法院提供还款的相关证据，如上述提到的银行转账记录、收据等。这些证据将有助于法院核实还款事实，并作出相应的处理。
三、申请结案或撤销执行申请
申请结案：如果法院已经对案件进行了立案执行，且对方已经全额履行了还款义务，您可以向法院申请结案。法院在核实相关情况后，会作出结案裁定，标志着案件的正式结束。
撤销执行申请：在某些情况下，如果您认为继续执行已无必要（例如，对方已经提前还清了全部债务，或者双方已经达成了和解协议并履行完毕），您也可以向法院提出撤销执行申请。法院在审查后，可能会同意您的申请并终止执行程序。
四、处理后续事项
解除保全措施：如果在执行过程中采取了财产保全措施（如查封、扣押、冻结等），在对方履行还款义务后，您应及时向法院申请解除这些保全措施。这是为了避免给对方造成不必要的损失，也是维护双方合法权益的重要一步。
关注费用退还：根据相关规定，如果执行申请费是由您预交的，且在执行过程中双方达成和解协议并已履行完毕的，法院可能会根据实际情况决定是否退还部分或全部执行申请费。因此，您可以关注这一费用的退还情况，确保自己的权益得到最大程度的保障。
综上所述，当对方在申请强制执行期间主动履行还款义务时，您应按照上述步骤及时处理，确保案件的顺利结束和自身权益的完全保障。