结论：在不知情的情况下使用了公司非法所得的客户资料，是否违法需结合具体情况判断，但一般而言，若能证明自身无过错，可能不构成直接违法；然而，仍可能面临一定的法律风险和责任。以下从不同角度进行详细分析：
一、主观过错与违法性的关系
主观过错原则：
- 在法律上，违法行为的认定通常要求行为人具有主观过错，即故意或过失。若您在使用客户资料时确实不知情，且没有合理的理由应当知情，那么从主观过错的角度来看，您可能不构成直接违法。
证明无过错：
- 然而，要证明自己确实不知情并非易事。您可能需要提供充分的证据，如公司内部的保密协议、您的工作职责说明、您获取客户资料的途径和方式等，以证明您在使用这些资料时没有过错。
二、可能面临的法律风险
民事责任：
- 即使您不知情，但如果您的行为导致了他人损害，您仍可能面临一定的民事责任。例如，如果客户资料被用于非法活动，导致他人财产损失或名誉受损，您可能因“过失”而被追究民事责任。
行政责任：
- 在某些情况下，即使您不知情，但如果您的行为违反了相关行政法规或规章，您仍可能面临行政处罚。例如，如果公司因非法获取客户资料而受到行政处罚，而您作为公司员工或相关责任人，可能因“未尽到合理注意义务”而被一并处罚。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果您的行为被认定为“帮助信息网络犯罪活动罪”等犯罪的共犯或从犯，即使您不知情，也可能面临刑事责任。但这通常要求您明知他人利用信息网络实施犯罪，而为其提供技术支持或帮助。若您确实不知情，且没有提供任何帮助，则此风险较低。
三、建议与措施
立即停止使用：
- 一旦发现客户资料可能涉及非法所得，应立即停止使用，并向上级或相关部门报告。
配合调查：
- 如果公司或相关部门对此事进行调查，应积极配合，提供必要的证据和信息。
加强法律意识：
- 未来在工作中，应加强对客户资料来源和合法性的审查，避免类似情况再次发生。
寻求法律帮助：
- 如果您对此事感到担忧或不确定如何处理，可以寻求专业律师的法律帮助，以更好地保护自己的合法权益。
总结：在不知情的情况下使用了公司非法所得的客户资料，是否违法需结合具体情况判断。但无论如何，您都应加强法律意识，谨慎处理客户资料，并在必要时寻求法律帮助。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。