如果林业部门没经过所有人同意就自行砍伐了树木，这通常属于违法行为，所有人有权要求相关部门承担责任并赔偿损失。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景
物权保护：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权是权利人依法对特定的物享有直接支配和排他的权利，包括所有权、用益物权和担保物权。树木作为不动产的一部分，其所有权受法律保护。未经所有权人同意，任何单位或个人不得擅自砍伐。
林业法规：我国有严格的林业法规，对树木的砍伐有明确的规定。一般来说，砍伐树木需要获得林业部门的许可，并按照规定的程序进行。未经许可擅自砍伐，将受到法律的制裁。
二、可能的情况与法律责任
误砍或误伐：
- 如果林业部门是由于工作失误或信息错误而砍伐了错误的树木，这仍然构成侵权行为。所有人有权要求林业部门停止侵害、恢复原状，并赔偿因此造成的损失。
非法砍伐：
- 如果林业部门明知树木不属于其管理范围或未经所有权人同意，仍然擅自砍伐，这构成故意侵权行为。所有人不仅可以要求赔偿损失，还可以要求林业部门承担更严重的法律责任，如行政处罚或刑事责任（如果构成犯罪的话）。
紧急情况下的砍伐：
- 在某些紧急情况下，如树木倒塌可能危及公共安全时，林业部门可能需要在未经所有权人同意的情况下进行砍伐。但这种情况下，林业部门应当尽快通知所有权人，并在事后进行合理的补偿。
三、建议与行动
收集证据：
- 所有人应当尽快收集相关证据，如照片、视频、证人证言等，以证明林业部门未经同意砍伐了树木。
与林业部门沟通：
- 在收集到足够证据后，所有人可以与林业部门进行沟通，要求其承认错误并赔偿损失。如果林业部门拒绝承认或赔偿，所有人可以考虑采取法律手段。
寻求法律援助：
- 如果所有人对法律程序不熟悉或无法与林业部门达成和解，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助所有人维护自己的合法权益。
报警或提起诉讼：
- 如果林业部门的砍伐行为构成犯罪（如故意毁坏财物罪），所有人可以向公安机关报案。同时，所有人也可以向人民法院提起民事诉讼，要求林业部门赔偿损失并承担法律责任。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中需要根据具体情况来制定策略。如果你遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。