针对您提出的“在甲方没有拨付工程款的情况下农民工工资该怎么办”这一问题，这确实是一个涉及多方权益保障的复杂但重要的问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确合同关系与责任主体
首先，需要仔细审查甲方与施工单位、农民工之间签订的合同。合同是明确各方权利和义务的基础，特别是关于支付工程款的具体时间和方式，必须清晰无误。如果甲方未按照合同约定履行支付义务，那么他就构成了违约行为，应当承担相应的法律责任。
二、友好协商与沟通
农民工层面：
- 农民工可以直接与施工单位沟通，表达自己的困难和诉求，要求尽快支付工资。
- 施工单位作为农民工的直接雇主，有责任确保工资的按时支付，并应积极与甲方协商，争取理解和支持。
施工单位层面：
- 施工单位可以与甲方进行正式协商，通过发送催款函等书面形式，明确告知拖欠的事实、金额以及可能产生的法律后果，要求甲方限期支付。
三、法律手段维权
如果协商无果，那么就需要采取法律手段来维护自己的权益了。
向劳动监察部门投诉：
- 农民工可以向当地劳动监察大队投诉，提交相关证据材料，如合同、工资单、催款函等。
- 劳动监察部门有权进行调查，并责令用人单位支付拖欠的工资。如果逾期不支付，还可以加付赔偿金。
申请劳动仲裁：
- 如果投诉未果，农民工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁委受理后会组织调解或裁决。如果对裁决结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。
提起诉讼或仲裁（依据合同约定）：
- 施工单位也可以根据合同中的仲裁条款，选择向仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼或仲裁过程中，需要提供充分的证据来支持自己的诉求，法院或仲裁机构将依法审理并作出判决或裁决。
四、寻求政府部门协调与法律援助
政府部门协调：
- 农民工或施工单位可以请求当地政府建设行政主管部门、信访部门等介入协调，推动问题的解决。
- 政府部门有责任和义务保障农民工的合法权益，促进社会和谐稳定。
法律援助：
- 如果经济困难，农民工可以向当地法律援助机构申请法律援助，获得免费的法律服务。
- 法律援助机构会指派律师为农民工提供法律咨询、代理诉讼等服务。
五、预防机制建立
为了避免类似问题的再次发生，建议在未来合同中增加保障条款和明确违约责任。
增加保障条款：
- 可以约定甲方在支付工程款时需提供保证金或担保物，确保按时足额支付。
明确违约责任：
- 在合同中明确约定违约责任和争议解决方式，为双方提供明确的法律保障。
总结
面对甲方不付工程款导致农民工工资被拖欠的问题，我们需要综合运用法律知识和实践经验，通过明确合同关系、友好协商、法律手段维权、政府部门协调及法律援助等多种途径来寻求最佳解决方案。同时，建立有效的预防机制也是至关重要的，可以从源头上减少类似问题的发生，切实保护农民工的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。