当您遇到结算单原件丢失但需要起诉的情况时，可以按照以下步骤来处理：

一、收集并整理其他相关证据

尽管结算单原件丢失，但您仍应尽力收集其他能够证明您与对方存在交易关系、对方应支付款项的证据。这些证据可能包括：

1. 复印件或扫描件：如果您有结算单的复印件或扫描件，这些文件可以作为辅助证据。
2. 交易记录：银行转账记录、电子支付凭证等，这些可以证明您与对方之间的资金往来。
3. 沟通记录：与对方就结算事宜进行的邮件、短信、微信等沟通记录，这些可以证明双方对结算事项有过讨论和确认。
4. 证人证言：如果有第三方见证了交易过程或结算事宜，他们的证言也可以作为证据。

二、尝试获取结算单的替代证明

1. 向出具方申请补发或出具证明：联系结算单的出具方（如医院、商家等），说明情况并请求他们补发结算单或出具一份证明，说明结算单的内容、金额及丢失情况。
2. 公示声明：在某些情况下，如医保结算单丢失，您可以通过官方渠道（如政府网站、公告栏等）发布公示声明，说明结算单丢失的情况，并承诺相关内容的真实性。这虽然不是直接的证据，但可以在一定程度上增强您主张的可信度。

三、咨询专业律师并准备起诉材料

1. 咨询律师：在起诉前，建议您咨询专业律师，了解您的案件是否具备起诉条件，以及如何收集和整理证据。
2. 准备起诉材料：根据律师的建议，准备起诉状、证据清单、身份证明等起诉材料。在起诉状中，应详细陈述事实、理由和诉讼请求，并附上相关证据。

四、向法院提起诉讼

1. 提交起诉材料：将准备好的起诉材料提交给有管辖权的法院。
2. 等待法院受理：法院会对您的起诉材料进行审查，如果符合受理条件，会出具受理通知书，并通知您缴纳诉讼费。
3. 参与庭审：在庭审过程中，您需要按照法院的安排参与庭审，陈述事实、提供证据，并回答法官和对方当事人的提问。

五、参考案例与注意事项

1. 参考案例：如您提供的安徽省池州市法律援助中心对吴某等三十六名农民工劳务合同提供法律援助案，该案中尽管部分农民工丢失了结算单原件，但通过收集其他证据和律师的专业代理，最终成功维护了自身权益。这为您提供了有益的参考。
2. 注意事项：在起诉过程中，您应保持冷静和理性，遵循法律程序和规定。同时，要注意保护自己的个人信息和隐私，避免泄露给不必要的人员。

综上所述，即使结算单原件丢失，您仍然可以通过收集其他相关证据、尝试获取替代证明、咨询专业律师并准备起诉材料等步骤来维护自己的权益。希望这些建议能对您有所帮助。