关于挂靠公司过户提档费法院如何判决的问题，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若提档费属于合理必要费用且合同有约定
   若双方在挂靠协议中明确约定了过户时需支付提档费（如车辆档案提取、手续办理等必要支出），且费用标准符合行业惯例或实际成本，法院通常会认定该约定有效。此时，提档费属于合同履行中的合理支出，法院可能支持收取方的主张，判决支付方承担费用。
   法律依据：根据《民法典》第509条，当事人应按约定全面履行义务；第465条，依法成立的合同受法律保护。

2. 若提档费属于变相收费或合同无约定
   若挂靠公司以提档费名义收取额外费用，且该费用未在合同中明确约定，或明显超出合理范围（如虚构项目、重复收费），法院可能认定该费用为“霸王条款”或无效格式条款。此时，法院可能驳回收取方的诉求，甚至要求退还已收取费用。
   法律依据：根据《民法典》第497条，提供格式条款一方不合理免除自身责任、加重对方责任的条款无效；第153条，违背公序良俗的民事法律行为无效。

3. 若提档费涉及行政性收费
   若提档费实际为车辆过户所需的行政性收费（如工本费、牌照费等），且由相关部门依法收取，法院会支持按实际发生金额支付。但若挂靠公司私自加收“服务费”“代办费”等，需进一步审查其合理性。
   提示：可要求挂靠公司出具费用明细及发票，核实是否包含非法收费项目。

实务建议：

• 审查挂靠协议中关于费用的条款，明确提档费是否约定及标准；
  
• 保留缴费凭证、沟通记录等证据，以备诉讼时举证；
  
• 若对费用合理性存疑，可向当地物价部门或行业协会咨询行业收费标准。
  

如有具体案件细节（如合同条款、费用金额等），可进一步向我说明，我会结合证据分析胜诉概率及策略。