请假半天是否会扣全勤奖，主要取决于公司的规章制度。以下是对此问题的详细分析：
公司规章制度明确规定的情况：
- 如果公司规章制度中明确规定了请假半天会扣除全勤奖，并且该制度已经通过合法程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定）并公示告知了员工，那么员工在请假半天后，公司有权按照规定扣除全勤奖。这种情况下，扣除全勤奖是合理的，因为员工在入职时已经知晓并同意了公司的相关规定。
公司规章制度无明确规定或规定不明确的情况：
- 若公司规章制度中没有明确规定请假半天会扣除全勤奖，或者规定存在模糊之处，从公平合理和保护劳动者权益的角度出发，公司不应仅凭请假半天就扣除员工的全勤奖。全勤奖作为公司对员工出勤表现的奖励，其发放与否及标准应由公司根据实际情况进行明确，并在规章制度中予以体现。如果规章制度未明确规定，员工有权要求公司按照实际情况处理全勤奖问题。
法律背景与建议：
- 全勤奖的性质：全勤奖是公司为了鼓励员工全月无缺席而设立的一种额外奖励制度，不属于工资范畴。因此，其发放与否、发放标准等均由公司根据自身情况自行决定，但这一决定必须建立在合法合规的基础上，不能侵犯劳动者的合法权益。
- 公司规章制度的合法性：公司在制定规章制度时，必须确保内容合理且不违反法律法规。规章制度应经过民主程序制定，并向劳动者公示告知，以确保其合法性和有效性。
- 员工权益保护：员工在请假前应仔细阅读公司的规章制度，了解请假对全勤奖的具体影响。如果对公司规章制度有疑问或不满，可以通过与人力资源部门沟通、协商等方式解决。在任何情况下，公司都不得因员工请假而扣减其应得的工资（不含全勤奖等额外奖励）。如果公司违规操作，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维护自己的合法权益。
总结与提醒：
- 请假半天是否扣全勤奖，关键在于公司的规章制度。员工在入职时应仔细了解并同意公司的相关规定，以避免后续纠纷。
- 如果公司规章制度未明确规定或规定不明确，员工有权要求公司按照实际情况处理全勤奖问题，并可以通过沟通、协商等方式维护自己的合法权益。
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