员工怀孕期间休息的工资支付，需根据休息性质及法律规定综合判断，具体如下：

1. 产检假
   根据《女职工劳动保护特别规定》第六条，怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间，用人单位应按正常工资标准支付。例如，员工上午请假产检，下午正常上班，则上午工资需全额发放。

2. 保胎假
   若员工因保胎需要请假，需提供医疗机构出具的证明。根据《国家劳动总局保险福利司关于女职工保胎休息和病假超过六个月后生育时的待遇问题给上海市劳动局的复函》，保胎假期间工资按病假工资标准支付，即不低于当地最低工资标准的80%（具体比例需参照地方规定）。

3. 产前假
   部分地区（如上海、江苏）规定，怀孕7个月以上且工作许可的，经本人申请、单位批准，可休产前假。产前假工资通常按原工资的80%支付，但需以地方性法规为准。例如，上海市《女职工劳动保护办法》第十二条明确此标准。

4. 产假
   产假期间工资支付分两种情况：

   • 生育津贴：若单位已缴纳生育保险，由社保机构按单位上年度职工月平均工资标准发放生育津贴。若生育津贴低于员工原工资，单位需补足差额。
     
   • 单位支付：若未缴纳生育保险，产假工资由单位按员工产假前工资标准全额支付。

5. 流产假
   根据《女职工劳动保护特别规定》第七条，怀孕未满4个月流产的，享15天产假；满4个月流产的，享42天产假。产假期间工资按产假工资标准支付，即生育津贴或单位原工资标准。

关键提醒：

• 员工需提供医疗机构证明（如病假条、产检记录等）作为请假依据；
  
• 用人单位不得因员工怀孕降低工资、辞退或解除劳动合同（《劳动合同法》第四十二条）；
  
• 若单位拒付工资或违法解除合同，员工可申请劳动仲裁，主张工资差额、赔偿金等权益。
  

如有具体案例或地方政策疑问，可进一步向我咨询。