骑手事故被扣工资是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：

一、若事故被认定为骑手责任且违反公司规章制度

1. 公司规章制度合法有效：如果公司有明确的规章制度，规定在骑手因自身原因导致事故并造成公司损失时，公司有权扣除一定比例的工资作为赔偿，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，那么这种扣除工资的行为在法律上可能是被允许的。但扣除的比例需合理，不能违反《工资支付暂行规定》中关于工资扣除的限制，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

2. 骑手存在故意或重大过失：如果事故是由于骑手的故意行为或重大过失导致的，且这种行为直接造成了公司的经济损失，那么公司根据规章制度扣除工资作为赔偿，在法律上是有一定依据的。但同样，扣除的比例和方式需符合法律规定。

二、若事故非骑手责任或公司规章制度存在问题

1. 事故非骑手责任：如果事故是由于第三方原因或不可抗力导致的，与骑手无关，那么公司无权扣除骑手的工资作为赔偿。此时，骑手可以要求公司全额支付工资，并有权对公司的违法行为进行投诉或举报。

2. 公司规章制度违法或未公示：如果公司的规章制度未经民主程序制定、未公示或告知劳动者，或者规章制度中的内容违反了法律法规的强制性规定，那么该规章制度对劳动者不具有约束力。此时，公司无权依据该规章制度扣除骑手的工资。

三、法律建议

1. 核实事故责任：骑手应首先核实事故的责任归属，明确自己是否应承担事故责任。如果事故非自己责任，那么公司无权扣除工资。

2. 审查公司规章制度：骑手应仔细审查公司的规章制度，确认其是否合法有效、是否经过公示或告知劳动者。如果规章制度存在问题，骑手可以拒绝公司的扣款要求。

3. 与公司协商或投诉：如果骑手认为公司的扣款行为不合法或不合理，可以与公司进行协商，要求公司全额支付工资。如果协商无果，骑手可以向当地的劳动监察部门投诉或举报公司的违法行为。

4. 寻求法律援助：如果骑手的权益受到严重侵害，且无法通过协商或投诉解决，可以寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

总结来说，骑手事故被扣工资是否合法，需根据事故责任归属、公司规章制度的合法性及公示情况等因素综合判断。如果骑手对公司的扣款行为有异议，建议及时与公司沟通或寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。