交通运输执法部门（如交警）在以下法定情形下可以扣留车辆：
因收集交通事故证据需要扣车
- 根据《道路交通事故处理程序规定》，在发生较为复杂的交通事故后，为了收集证据，确定事故发生的原因、双方责任等情况，公安机关交通管理部门有权扣留事故车辆，并开具行政强制措施凭证。扣留的车辆应当妥善保管，以备核查。同时，交警需在检验报告、鉴定意见确定之日起五日内通知当事人领取车辆，逾期未领取的，停车费用由当事人自行承担。
车辆存在违法行为且不符合上路行驶条件时扣车
- 无牌无证车辆：上道路行驶的机动车若未悬挂机动车号牌，未放置检验合格标志、保险标志，或者未随车携带行驶证、驾驶证，公安机关交通管理部门将扣留机动车。
- 伪造、变造或使用伪造、变造的证件：对于使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的车辆，公安机关交通管理部门不仅将扣留该机动车，还会处以相应的罚款；构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
- 达到报废标准或非法改装车辆：驾驶拼装的机动车、已达到报废标准的机动车上路，或擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据，交警均有权扣留车辆，并根据具体情况进行强制报废或责令恢复原状。
- 严重道路交通安全违法行为：如交由未取得机动车驾驶证或驾驶证被吊销、暂扣的人驾驶，机动车行驶超过规定时速百分之五十等，公安机关交通管理部门也会扣留机动车驾驶证或车辆。
- 超载或未按规定投保：公路客运车辆载客超过额定乘员，货运机动车超过核定载质量，或未按照国家规定投保机动车交通事故责任强制保险的，交警同样会扣留车辆至违法状态消除，并处以相应罚款。
车辆涉嫌其他违法犯罪活动扣车
- 如果车辆涉及盗抢、走私等违法犯罪活动，交警在执法过程中发现线索后，将依法扣留车辆，并配合相关部门进行调查处理。对于有机动车被盗抢嫌疑、拼装或达到报废标准嫌疑等情形的，交警也会扣留车辆进行进一步调查。
在执法过程中，交通运输执法部门必须严格遵守法定程序：
- 出示执法证件：交通警察执行职务时，应当按照规定着装，佩带人民警察标志，持有人民警察证件，保持警容严整，举止端庄，指挥规范。
- 开具行政强制措施凭证：扣留车辆时，应当向当事人出具行政强制措施凭证，并告知扣留的理由、依据以及当事人依法享有的权利、救济途径。
- 妥善保管被扣留车辆：被扣留的车辆应当妥善保管，不得使用或擅自处理。因保管不善造成损失的，应当承担赔偿责任。
车主和驾驶员应自觉遵守交通法规，避免车辆被扣留的情况发生。如果对交通运输执法部门的扣车行为有任何疑问或认为存在不当之处，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律建议。