结论：国有销售部副总经理拿了销售员的一部分提成款，这一行为是否违法，需结合具体情况判断，但通常可能涉及违法或违规行为。

分析角度一：公司内部规章制度

1. 公司规定：首先，需要查看公司的内部规章制度，特别是关于销售提成分配的规定。如果公司明确规定了销售提成的分配方式，且副总经理的行为违反了这些规定，那么这一行为就构成了对公司规章制度的违反，可能受到公司内部的纪律处分。

2. 职务侵占风险：若副总经理利用职务之便，擅自将销售员的提成款据为己有，且数额较大，这可能构成职务侵占行为。职务侵占是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占行为可能面临刑事处罚。

分析角度二：法律法规层面

1. 国有资产保护：由于涉及国有企业，还需考虑国有资产的保护问题。国有企业的资产属于国家所有，任何侵占、挪用国有资产的行为都是违法的。如果副总经理的行为导致国有资产流失，那么这一行为就可能违反了国有资产保护的相关法律法规。

2. 贪污受贿风险：如果副总经理在拿取销售员提成款的过程中，存在利用职务之便为他人谋取利益并收受财物的行为，那么这可能构成贪污受贿。贪污受贿是严重的违法犯罪行为，会受到法律的严厉制裁。

分析角度三：合同与劳动关系

1. 劳动合同：销售员与国有企业之间通常存在劳动合同关系。如果副总经理的行为违反了劳动合同中关于薪酬分配的规定，销售员有权依据劳动合同向公司主张权利，要求公司纠正这一行为并赔偿损失。

2. 劳动争议解决：若因此产生劳动争议，销售员可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。

建议：

• 对于销售员而言，如果发现副总经理有拿取自己提成款的行为，应首先收集相关证据，如提成分配记录、公司规章制度等。
• 然后，可以与公司内部相关部门（如人力资源部、法务部等）进行沟通，要求公司对此事进行调查并给出处理意见。
• 如果公司未能妥善处理此事，销售员可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

后续行动提示：

• 在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，避免采取过激行为。
• 同时，要注意保护自己的合法权益，不要因为害怕报复或其他原因而放弃维权。

如有更多细节或疑问，可以直接向我咨询，我会结合具体情况为你提供更详细的法律建议。