核心结论：开店出资方未注明出资性质出现纠纷时，可通过协商、诉讼或仲裁等途径解决，具体需根据出资协议的完善程度、出资实际用途及双方证据情况来综合判断和处理。以下分情况详细说明：

1. 尝试协商解决

   • 分析：在纠纷初期，双方应首先尝试通过友好协商的方式解决。协商过程中，可以回顾出资时的初衷、出资后的实际使用情况以及双方对店铺经营的贡献等因素，尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
   • 建议：在协商时，建议双方明确各自的出资性质（如股权出资、债权出资或赠与等），并签订书面协议，以避免未来再次发生类似纠纷。

2. 依据出资协议及实际履行情况判断

   • 分析：如果双方曾签订过出资协议，即使未明确注明出资性质，也可以根据协议中的其他条款（如出资比例、分红方式、管理权分配等）以及出资后的实际履行情况来推断出资性质。例如，如果出资方按照出资比例享有分红权，且参与店铺管理，那么其出资很可能被视为股权出资。
   • 建议：收集并整理所有与出资相关的证据，包括出资协议、转账记录、店铺经营记录等，以便在纠纷解决过程中提供有力支持。

3. 通过诉讼或仲裁解决

   • 分析：如果协商无果，双方可以选择通过诉讼或仲裁的方式解决纠纷。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定，对出资性质进行认定，并作出相应的裁决。
   • 建议：
     • 诉讼：向有管辖权的人民法院提起诉讼，提交起诉状及相关证据材料。在诉讼过程中，要积极配合法院的调查和审理工作，及时提供补充证据。
     • 仲裁：如果双方曾在出资协议中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么可以选择向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序相对灵活且保密性较强，但裁决结果具有终局性。

4. 考虑出资的实际用途和目的

   • 分析：在判断出资性质时，除了考虑出资协议和实际履行情况外，还应考虑出资的实际用途和目的。例如，如果出资方明确表示其出资是为了获得店铺的股权，并且出资后确实参与了店铺的管理和决策，那么其出资更有可能被认定为股权出资。
   • 建议：在纠纷解决过程中，要充分阐述出资的实际用途和目的，并提供相关证据加以证明。

5. 预防未来纠纷的建议

   • 分析：为了避免未来再次发生类似纠纷，建议在未来的出资协议中明确注明出资性质、出资比例、分红方式、管理权分配等关键条款，并签订书面协议。
   • 建议：在签订出资协议前，务必对协议条款进行仔细审查和协商，确保双方对协议内容有充分的理解和认同。如有必要，可以寻求专业法律人士的帮助。