在建设发电厂工程中，若存在分包再分包的情况，最下层的分包单位（即实际施工人）通常应向与其有直接合同关系的上一级分包单位主张工程款。不过，具体情形还需根据实际情况和法律规定来详细分析，以下从不同角度为你展开说明：

一、合同相对性原则

在建设工程领域，合同相对性原则是一项基本原则。这意味着，合同只对签订合同的双方具有约束力，对合同以外的第三人不产生法律效力。因此，最下层的分包单位通常只能向与其有直接合同关系的上一级分包单位主张工程款。如果最下层分包单位直接向总承包单位或建设单位主张工程款，可能会因缺乏合同依据而面临法律障碍。

二、实际施工人的特殊保护

尽管合同相对性原则是基本原则，但在建设工程领域，为了保护实际施工人的合法权益，法律也规定了一些特殊情形下的突破。根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等相关规定，在转包、违法分包等情形下，实际施工人（即最下层的分包单位）有权向发包人（即建设单位）主张工程款，但这一权利的行使通常需要满足一定条件，如：

1. 实际施工人已经完成或部分完成了建设工程施工合同约定的工程内容；
2. 发包人欠付转包人或者违法分包人建设工程价款；
3. 实际施工人能够证明其与转包人或者违法分包人之间存在事实上的建设工程施工合同关系。

三、实际操作中的建议

1. 收集证据：最下层的分包单位在主张工程款时，应首先收集与上一级分包单位签订的合同、工程完成情况、结算单据等相关证据，以证明其与上一级分包单位之间的合同关系以及工程款的数额。
2. 协商解决：在证据充分的情况下，最下层的分包单位可以尝试与上一级分包单位进行协商，寻求和解或达成还款协议。
3. 法律途径：如果协商无果，最下层的分包单位可以向人民法院提起诉讼或申请仲裁，要求上一级分包单位支付工程款。在符合上述特殊保护情形时，也可以考虑直接向发包人主张工程款。

四、风险提示

1. 合同效力问题：如果最下层的分包单位与上一级分包单位之间的合同存在无效情形（如违法分包、转包等），则可能影响工程款的主张。因此，在签订合同时应确保合同的合法性和有效性。
2. 诉讼时效问题：在主张工程款时，应注意诉讼时效的限制。一般来说，建设工程合同纠纷的诉讼时效为三年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。因此，最下层的分包单位应及时行使权利，避免超过诉讼时效。

综上所述，最下层的分包单位在主张工程款时，应首先依据合同相对性原则向与其有直接合同关系的上一级分包单位主张权利。在符合法律规定的特殊情形下，也可以考虑向发包人主张工程款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。