小区楼顶建鸽棚是否合法，需分情况讨论：

1. 若鸽棚建设未经规划部门批准，且违反城市规划相关规定：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，任何单位和个人在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，必须向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。若鸽棚建设未取得规划许可，则属于违法建设，可能面临被责令拆除、罚款等法律后果。

2. 若鸽棚建设虽经规划部门批准，但违反物业管理相关规定或侵害其他业主权益：

   • 即便鸽棚建设取得了规划许可，若其建设过程中或建成后违反了小区物业管理规定，如影响了小区的整体美观、安全或卫生等，或者侵害了其他业主的合法权益（如噪音扰民、影响采光等），则可能面临物业公司的管理措施或相邻业主的诉讼。在此情况下，建设者可能需要承担相应的民事责任，如停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

3. 若鸽棚建设符合规划及物业管理规定，且未侵害其他业主权益：

   • 在这种情况下，鸽棚建设可能是合法的。但需要注意的是，即使鸽棚建设合法，建设者仍需遵守相关法律法规和物业管理规定，确保鸽棚的使用不会对小区环境和其他业主造成不良影响。

法律建议：

• 在建设鸽棚前，建议先向当地规划部门咨询并办理相关规划许可手续，确保建设行为的合法性。
• 同时，应与物业公司沟通，了解小区物业管理规定，确保鸽棚建设符合小区管理要求。
• 在建设过程中，应尽量减少对小区环境和其他业主的影响，避免引发不必要的纠纷。

可能后果：

• 若鸽棚建设违法或违反物业管理规定，可能面临被责令拆除、罚款等行政处罚，以及承担民事责任的风险。
• 若因鸽棚建设引发纠纷，可能耗费大量时间和精力进行诉讼或调解，影响正常生活和工作。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。