占用小区绿化私自种菜是违法的。这一行为不仅违反了相关法律法规，也侵害了小区的公共利益和其他业主的合法权益。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律层面
违反《中华人民共和国民法典》：
- 根据《民法典》第二百七十四条，建筑区划内的绿地，除非属于城镇公共绿地或明示属于个人，否则属于业主共有。未经其他业主同意，在公共绿地种菜侵犯了全体业主的共同利益，构成对他人合法权益的侵害。其他业主有权要求种菜者停止侵害、恢复原状。
违反《物业管理条例》：
- 该条例规定，业主应遵守管理规约，不得擅自改变物业使用性质或占用公共区域。在小区公共区域种菜改变了绿地的使用性质，违反了物业管理条例的相关规定，物业公司有权要求整改。
违反城市绿化管理相关法规：
- 许多城市有专门的城市绿化管理条例，如《北京市绿化条例》，明确禁止擅自占用城市绿化用地。小区内的绿地属于城市绿化的一部分，种菜属于擅自改变绿化用地用途的违法行为，城市绿化行政主管部门有权责令停止并恢复原状，还可能处以罚款。
违反《城市市容和环境卫生管理条例》：
- 在小区内种菜可能破坏公共区域的整洁和美观，违反了关于维护城市市容和环境卫生的法规要求，影响小区的整体居住环境。
二、处理流程
沟通与协商：
- 发现违规行为后，业主或物业应首先尝试与行为人进行友好沟通，解释相关法律法规和管理规定，指出其行为的不当之处，并要求其停止侵占绿化区域、恢复原状。
书面通知与整改：
- 如果沟通协商未能解决问题，物业应向违规的业主或行为人发出书面的整改通知。通知应明确指出其行为的违法违规之处，要求其在规定的期限内自行清除菜苗、恢复绿化，并告知逾期不整改可能面临的法律后果，如罚款、诉讼等。
向相关部门投诉：
- 若行为人仍拒不整改，物业或业主可以向当地城管部门投诉，城管部门有权对违法行为进行查处，责令行为人限期改正，并可根据情节轻重处以罚款。同时，也可以向街道办事处或社区居委会求助，他们可以介入调解，组织相关方进行协商，推动问题的解决。
法律诉讼：
- 若上述措施均无法解决问题，业主委员会可作为原告，以维护全体业主的公共利益为由，向人民法院提起诉讼，要求行为人停止侵害、排除妨碍、恢复原状，并赔偿因破坏绿化区域给小区造成的损失。受影响的单个业主也可以提起相邻权诉讼，要求行为人消除影响、赔偿损失。
三、预防与管理
为预防类似情况的再次发生，物业应加强对小区公共区域的巡查和管理力度。通过定期巡查、加强宣传和教育等方式，提高业主对公共区域保护的意识和责任感。同时，也可以考虑在小区内设置专门的种植区域，满足业主的种植需求，但需确保该区域不违反相关法律法规和小区管理规约。
总结：占用小区绿化私自种菜是违法的，不仅违反了相关法律法规，也侵害了小区的公共利益和其他业主的合法权益。在处理此类问题时，应遵循合法、合理、公正的原则，通过沟通、协商、书面通知、投诉、诉讼等多种手段确保问题得到妥善解决。如果你或他人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律建议和帮助。