结论前置：小区内私自种菜是否违法，需根据具体情况判断，主要涉及土地使用权、土地使用性质、小区管理规约以及是否影响他人权益或公共安全等多个因素。以下是对此问题的详细分析：

1. 土地使用权与性质

   • 合法土地使用权：若业主对种菜区域拥有合法的土地使用权，如购房合同中明确约定该区域归其专有使用，且该区域在规划上并未明确禁止农业种植，那么业主在该区域内种菜通常是不违法的。但需注意，即使拥有合法土地使用权，业主也需遵守相关法律法规，不得使用违禁农药、化肥等污染环境。
   • 违反土地使用性质：若种菜区域的土地在规划用途上有明确规定，如规划为景观用地、公共绿化用地等，则业主在该区域种菜可能违反了土地使用性质的相关规定。根据《中华人民共和国城乡规划法》，未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，将面临责令停止建设、限期改正、罚款甚至拆除等处罚。

2. 小区管理规约

   • 小区管理规约是全体业主共同制定的行为准则，对全体业主具有约束力。如果管理规约中明确禁止在小区公共区域或特定区域内种菜，那么业主的种菜行为就构成了违约。此时，其他业主或物业管理公司有权要求该业主停止种菜行为并恢复原状。若业主拒不执行，可能会面临法律诉讼和相应的违约责任。

3. 影响他人权益或公共安全

   • 如果业主在种菜过程中使用了有刺鼻气味的肥料或滋生了大量蚊虫，对相邻业主的生活环境造成了不良影响，就可能构成相邻权侵权。根据《中华人民共和国民法典》中关于相邻关系的规定，给相邻方造成妨碍或者损失的，应当停止侵害、排除妨碍并赔偿损失。
   • 此外，如果种菜搭建的设施存在安全隐患，如搭建的棚架不稳固可能倒塌伤人，影响到公共安全，也可能违反相关的安全管理规定，面临相应的法律责任。

4. 具体处理步骤

   • 沟通与协商：发现违规行为后，业主或物业应首先尝试与行为人进行友好沟通，解释相关法律法规和管理规定，指出其行为的不当之处，并要求其停止侵占绿化区域、恢复原状。
   • 书面通知与整改：如果沟通协商未能解决问题，物业应向违规的业主或行为人发出书面的整改通知。通知应明确指出其行为的违法违规之处，要求其在规定的期限内自行清除菜苗、恢复绿化，并告知逾期不整改可能面临的法律后果。
   • 向相关部门投诉：若行为人仍拒不整改，物业或业主可以向当地城管部门投诉，城管部门有权对违法行为进行查处，责令行为人限期改正，并可根据情节轻重处以罚款。同时，也可以向街道办事处或社区居委会求助，他们可以介入调解，组织相关方进行协商，推动问题的解决。
   • 法律诉讼：若上述措施均无法解决问题，业主委员会可作为原告，以维护全体业主的公共利益为由，向人民法院提起诉讼，要求行为人停止侵害、排除妨碍、恢复原状，并赔偿因破坏绿化区域给小区造成的损失。受影响的单个业主也可以提起相邻权诉讼，要求行为人消除影响、赔偿损失。

建议：为避免不必要的法律纠纷和麻烦，建议业主在种菜前先了解清楚相关法律法规、小区管理规约以及土地使用性质等规定，并确保自己的种菜行为不会侵犯他人的合法权益和公共安全。如有任何疑问或不确定之处，可直接向我咨询，我会为你提供准确的法律意见和指导。