合同中约定未干满三年扣工资总额10%的条款是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：
法律角度
违反劳动法规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位无权因劳动者未干满约定年限而扣除工资。
- 此类条款可能被视为对劳动者权益的侵害，违反了劳动法的公平、公正原则。
违反劳动合同法规定：
- 《中华人民共和国劳动合同法》明确规定，用人单位与劳动者订立的劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。
- 约定未干满三年扣工资总额10%的条款，显然违反了公平、自愿的原则，可能被视为无效条款。
实践角度
执行难度大：
- 即使合同中有此类约定，实际执行时也可能面临诸多困难。例如，如何准确计算“未干满三年”的具体时间？如何确保扣除的工资比例准确无误？
- 此类条款的执行可能引发劳动争议，增加用人单位的诉讼成本和风险。
影响员工积极性：
- 此类条款可能对员工的工作积极性产生负面影响。员工可能因担心未干满年限而被扣工资，而选择提前离职或消极工作。
- 这对用人单位的长期发展和团队稳定性都是不利的。
建议
修改合同条款：
- 用人单位应重新审视并修改合同中的此类条款，确保其符合法律法规的要求，同时体现对劳动者的尊重和公平。
- 可以考虑采用其他激励方式，如奖金、晋升机会等，来鼓励员工长期服务。
加强法律意识：
- 用人单位应加强对劳动法律法规的学习和了解，确保自身的用工行为合法合规。
- 劳动者也应增强自身的法律意识，了解自己的权益和义务，避免因不了解法律而遭受损失。
协商解决争议：
- 如果因此类条款引发劳动争议，双方应首先通过协商的方式解决。
- 协商不成的，可以依法向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
总结：合同中约定未干满三年扣工资总额10%的条款是不合法的，既违反了劳动法的规定，也可能在实践中引发诸多问题。用人单位应重新审视并修改此类条款，确保用工行为的合法性和公平性。如果您或您所在的单位遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。