核心结论：针对员工在超市结算单上签名但货款未交回公司的情况，需根据具体情形采取不同措施，包括内部追责、协商解决、法律追偿等。以下是详细分析：

1. 内部追责与流程核查

• 核查流程漏洞：首先需确认公司结算流程是否存在漏洞（如未实时核对收款与签字记录、未设置双重确认机制等）。若因流程缺陷导致员工有机可乘，公司应优先完善制度，避免后续风险。
• 员工责任认定：若员工故意未交款，需明确其职责范围（如收银员、财务人员等）。根据《劳动合同法》第三十九条，员工严重违反公司规章制度或失职造成重大损失的，公司可解除劳动合同并要求赔偿。

2. 协商与催告

• 书面催告：公司应向员工发出书面催告函，要求其在指定期限内补交货款，并保留送达证据（如邮寄回执、签字确认单等）。
• 协商解决：若员工承认错误并承诺还款，可签订书面还款协议，明确还款期限及违约责任（如逾期利息、违约金等），降低后续纠纷风险。

3. 法律追偿途径

• 民事诉讼：若员工拒不还款，公司可依据《民法典》第五百七十七条（违约责任）向法院起诉，要求员工返还货款并赔偿损失。需准备证据：结算单签字记录、催告函、员工职责证明等。
• 刑事报案：若员工涉嫌职务侵占（金额达6万元以上）或挪用资金，公司可向公安机关报案。根据《刑法》第二百七十一条，职务侵占罪最高可处十年以上有期徒刑或无期徒刑。

4. 预防措施建议

• 完善制度：建立“签字-收款-核对”三重确认机制，确保每笔交易实时闭环。
• 定期审计：对收银岗位进行不定期抽查，核对系统记录与实际收款是否一致。
• 员工培训：加强职业道德与法律风险培训，明确违规后果（如纳入征信、行业禁入等）。

行动建议：

1. 立即暂停该员工涉及财务的工作权限；
   
2. 委托律师发送律师函，强化法律威慑；
   
3. 根据金额大小决定是否启动刑事报案程序。
   

如有进一步细节（如员工身份、未交款金额、公司制度等），可提供更多信息以便针对性分析。