结论前置：即使您在离职申请中写了个人原因，如果公司确实存在拖欠工资的行为，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

离职证明与真实离职原因

1. 离职证明的效力：离职证明是用人单位出具的，用于证明劳动者与用人单位解除或终止劳动关系的文件。它通常基于双方协商一致的结果，但并不一定完全反映离职的真实原因。
2. 真实离职原因的证明：如果离职证明上写的是个人原因离职，但实际是因公司拖欠工资而离职，您可以通过其他证据来证明真实的离职原因。这些证据可以包括工资条、银行流水、工作记录、与用人单位的沟通记录等，这些都能有效证明公司拖欠工资的事实。

拖欠工资的法律责任

1. 法律规定：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当及时足额支付劳动者的工资。如果用人单位拖欠工资，劳动者有权解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。
2. 经济补偿金的标准：经济补偿金的标准通常按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

仲裁申请的依据与流程

1. 仲裁申请的依据：在申请劳动仲裁时，您应提供充分证据证明公司存在拖欠工资的事实。这些证据将作为仲裁机构审理案件的重要依据。
2. 仲裁流程：
   • 提交仲裁申请：您需要在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内，向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。
   • 仲裁受理：仲裁委员会在收到申请后，会进行审查，并在五日内决定是否受理。
   • 开庭审理：如果仲裁委员会决定受理，会安排开庭审理，双方当事人需要出庭陈述事实、提供证据。
   • 裁决：仲裁委员会在审理结束后，会根据事实和法律规定作出裁决。

特殊情况下的处理

1. 存在欺诈、胁迫等情形：如果您能证明书写个人原因离职并非您的真实意愿，而是受到了公司的欺诈、胁迫或基于重大误解，您仍然有权申请仲裁，并有可能获得支持。
2. 公司存在其他违法情形：即使离职原因写的是个人原因，如果公司还存在其他侵害您合法权益的违法行为，如未依法缴纳社会保险费、未支付加班费等，您仍然可以就这些具体的违法行为申请仲裁。

建议与注意事项

1. 收集并保留证据：在申请仲裁前，您应尽可能收集并保留所有与拖欠工资相关的证据，以便在仲裁过程中提供有力支持。
2. 及时提出仲裁申请：不要拖延时间，以免超过仲裁时效。一旦发现公司存在拖欠工资的行为，应尽快采取行动。

总结：离职时写个人原因并不构成申请劳动仲裁的绝对障碍。只要您能提供充分证据证明公司存在拖欠工资等违法行为，并且这些行为直接导致了您权益的损害，您就有权在劳动关系终止之日起一年内提出劳动仲裁申请。如果您在准备仲裁材料或申请过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。